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公开(公告)号：CN104769129A
公开(公告)日：2015-07-08
申请号：CN201280076912.6
申请日：2012-11-15
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6881 , C12Q2600/156 , C12Q2600/112
摘要： 本发明涉及一种主要组织相容性复合体MHC分型方法及其应用。具体地，本发明提供了主要组织相容性复合体MHC型别数据库及其构建方法和构建单元、SNP和InDel检测方法和检测单元、SNP和InDel的拼接方法及拼接单元、以及主要组织相容性复合体MHC分型方法及其单元和系统。本发明方法和系统准确性高(可以达到98％以上)，对待测的数据要求比较低、相对于现有的分型方法，大大提高了分型区域。
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公开(公告)号：CN103874767A
公开(公告)日：2014-06-18
申请号：CN201180074176.6
申请日：2011-12-21
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6874 , C12Q1/6869 , C12Q1/6883 , C12Q2600/156
摘要： 本发明公开了对核酸样本中预定区域进行基因分型的方法和系统。对核酸样本中预定区域进行基因分型的方法包括下列步骤：使用引物组对核酸样本进行扩增，以便获得扩增产物，其中所述引物组是预定区域特异性的；针对所述扩增产物，构建测序文库；对测序文库进行测序，以便获得由多个测序数据构成的测序结果；确定来自预定区域的测序数据；以及基于来自预定区域的测序数据的组成，对预定区域进行基因分型。
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公开(公告)号：CN102758026B
公开(公告)日：2014-05-07
申请号：CN201210222621.5
申请日：2012-06-29
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
摘要： 提供了HBV核酸样本突变位点类型的检测方法、PCR引物、标签引物及其试剂盒。其中，确定HBV核酸样本中突变位点类型的方法包括：使用第一引物组，对所述HBV核酸样本进行扩增，以便得到第一扩增产物；对所述第一扩增产物进行测序；基于测序结果，确定HBV核酸样本中是否存在突变，其中，所述第一引物组包含第一引物和第二引物，所述第一引物具有SEQ？ID？NO:1所示的核苷酸序列，所述第二引物具有SEQ？ID？NO：2所示的核苷酸序列，所述第一引物的5’端进一步包含第一标签序列，所述第二引物的5’端进一步包含第二标签序列。利用该方法能够有效确定HBV核酸样本中是否存在突变。
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公开(公告)号：CN102352370B
公开(公告)日：2014-04-16
申请号：CN201110310267.7
申请日：2011-10-13
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
摘要： 本发明提供了一种构建体、重组细胞及其用途。其中，根据本发明实施例的构建体包括：第一核酸序列，所述第一核酸序列包括编码报告蛋白的序列，所述报告蛋白具有可检测的活性；以及第二核酸序列和第三核酸序列，所述第二和第三核酸序列分别位于所述第一核酸序列的5’侧和3’侧，所述第二核酸序列和第三核酸序列不同，并且分别独立地为宿主细胞芳香族化合物降解途径特异性基因的非功能片段。利用该构建体构建的重组细胞能够有效地对芳香族化合物进行检测，另外，根据本发明的实施例还提供了检测样本中芳香族化合物的方法、系统、试剂盒以及筛选具有降解芳香族化合物活性的制剂的方法。
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公开(公告)号：CN103184170A
公开(公告)日：2013-07-03
申请号：CN201110448525.8
申请日：2011-12-28
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC分类号： C12N1/20 , A61K35/74 , A61P37/02 , A61P35/00 , A61P1/00 , A61P9/12 , A61P3/06 , A61P39/06 , A23L1/30 , A23K1/16 , C12R1/225
摘要： 本发明的乳酸杆菌LY-73(Lactobacillus shenzhenensis sp.nov.)，是一种分离的全新的乳酸杆菌菌株，其保藏号为：CCTCC M2011481。该菌株具有高产EPS的特性，可应用于微生态制剂、食品、医药制备、保健品等多个领域。
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公开(公告)号：CN103082292A
公开(公告)日：2013-05-08
申请号：CN201110342339.6
申请日：2011-11-02
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
CPC分类号： A61K35/74 , A23L33/135 , A23V2002/00 , A61K9/19 , C12N1/20 , Y02A50/481
摘要： 本发明提供了罗斯氏菌(Roseburia)在治疗和预防肥胖相关疾病中的应用，本发明提供了罗斯氏菌在治疗和预防肥胖相关疾病中的用途，还提供了一种用于治疗和预防肥胖相关疾病的组合物，包括药品、饮料、食品，或动物饲料组合物等，以及降低体重和/或血糖的方法。
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公开(公告)号：CN101748213B
公开(公告)日：2013-05-08
申请号：CN200910258132.3
申请日：2009-12-14
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
摘要： 本发明适用于生物工程领域，提供了一种环境微生物检测方法和系统，所述方法包括下述步骤：采用高通量的测序技术对从环境样本中提取的DNA进行测序，得到DNA标签序列；去除所述DNA标签序列中存在的载体污染；将所述DNA标签序列与已知数据库中的已知序列进行比对，并根据比对结果确定所述DNA标签序列的所属分类。本发明实施例可以检测到环境样本中可能存在哪些微生物物种或哪一类微生物物种。
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公开(公告)号：CN102517392A
公开(公告)日：2012-06-27
申请号：CN201110439198.X
申请日：2011-12-26
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
摘要： 本发明公开一种基于宏基因组16S高可变区V3的分类方法和装置。该方法包括：提取微生物样品中的DNA；对宏基因组16S rDNA的高可变区V3进行扩增，对扩增产物进行Solexa建库，同时在建库过程中通过加上带有标签序列的接头，对每个样品进行标记；将带有标签序列的不同样品进行混合，混合后使用Solexa测序工具进行测序，得到按照标签区分的原始的测序序列reads；利用reads的重叠关系组装得到高可变区V3的全长序列unique reads；对unique reads进行分类分析，以实现对微生物群体的分类。本发明的方法和装置，对微生物群体的分类准确，且大大降低了测序成本。
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