建立分子结构与活性数据库的方法

    公开(公告)号:CN111415702B

    公开(公告)日:2023-05-05

    申请号:CN202010140921.3

    申请日:2020-03-03

    摘要: 本发明提供建立分子结构与活性数据库的方法,从化合物数据库上进行搜索获取与选定靶点相关的所有化合物,并记录化合物的相关信息,按照需求将外部数据转换成为标准化格式;对数据进行校验核对确保数据的准确性;将校验通过存储的临时文件,上传至MongoDB数据库中;用户通过SDK向数据检索模块发送检索请求,根据用户的需求选取某一特定的靶点,提取包含该靶点的全部数据;调用Jupyter中的构效分析模块,根据用户所输入的母核结构以及相似度的要求,对该结构与数据库中的结构进行亚结构匹配以及相似度比较计算。本发明适用于计算机辅助药物设计以及虚拟筛选等药物筛选,实现了半自动化收集数据以及清洗数据生成标准化数据库。

    建立分子结构与活性数据库的方法

    公开(公告)号:CN111415702A

    公开(公告)日:2020-07-14

    申请号:CN202010140921.3

    申请日:2020-03-03

    摘要: 本发明提供建立分子结构与活性数据库的方法,从化合物数据库上进行搜索获取与选定靶点相关的所有化合物,并记录化合物的相关信息,按照需求将外部数据转换成为标准化格式;对数据进行校验核对确保数据的准确性;将校验通过存储的临时文件,上传至MongoDB数据库中;用户通过SDK向数据检索模块发送检索请求,根据用户的需求选取某一特定的靶点,提取包含该靶点的全部数据;调用Jupyter中的构效分析模块,根据用户所输入的母核结构以及相似度的要求,对该结构与数据库中的结构进行亚结构匹配以及相似度比较计算。本发明适用于计算机辅助药物设计以及虚拟筛选等药物筛选,实现了半自动化收集数据以及清洗数据生成标准化数据库。