公开(公告)号：CN119580831A

公开(公告)日：2025-03-07

申请号：CN202411307532.X

申请日：2024-09-19

Applicant: 湖南农业大学

Inventor： 袁哲明 ,  张叱风 ,  黄建军 ,  蒋思危 ,  余沛毅 ,  刘纯海 ,  代志军 ,  李兰芝

IPC: G16B20/20 ,  G16B40/00 ,  G16B30/10 ,  G06N20/00

Abstract: 本发明属于生物信息学领域，具体涉及定量性状多位点振荡搜索全基因组关联分析系统及方法。本发明提供一种利用定量性状多位点振荡搜索全基因组关联分析系统进行全基因组关联分析的方法，所述方法目标是找出与特定表型相关的SNP位点即PseQTNs，包括如下步骤：S1数据准备：准备SNP矩阵文件和表型矩阵文件；S2数据预处理：将录入的SNP矩阵去重并按列标准化，对表型矩阵按列标准化；S3关联分析：通过振荡搜索策略，从SNP矩阵中筛选出与表型相关的SNP位点即PseQTNs。本发明在动植物重要性状相关基因挖掘、人类复杂疾病相关基因挖掘等方面有重要、切实应用价值。

公开(公告)号：CN103077313A

公开(公告)日：2013-05-01

申请号：CN201310007830.2

申请日：2013-01-09

Applicant: 湖南农业大学

Inventor： 周玮 ,  袁哲明 ,  吴树波 ,  代志军 ,  陈渊 ,  韩娜

IPC: G06F19/00

Abstract: 本发明公开了一种酚对发光菌毒性预测及评估的新型非线性高效模型的构建方法及应用，利用非线性SVR技术对源自现有技术的18个酚类化合物对发光菌的毒性表示为log EC50进行QSAR研究。这项工作的目的是基于低维特征数据和高维特征数据，通过非线性化学计量学工具寻找更合理的特征和更可靠的QSAR模型，并详细分析与毒性相关的最有价值模型及其最关键的分子特征。本发明将为设计对发光菌毒性增强或减弱的酚类似物提供有效的理论参考。

公开(公告)号：CN103077313B

公开(公告)日：2016-12-28

申请号：CN201310007830.2

申请日：2013-01-09

Applicant: 湖南农业大学

Inventor： 周玮 ,  袁哲明 ,  吴树波 ,  代志军 ,  陈渊 ,  韩娜

IPC: G06F19/00

Abstract: 本发明公开了一种酚对发光菌毒性预测及评估的非线性高效模型的构建方法及应用，利用非线性SVR技术对源自现有技术的18个酚类化合物对发光菌的毒性表示为log EC50进行QSAR研究。这项工作的目的是基于低维特征数据和高维特征数据，通过非线性化学计量学工具寻找更合理的特征和更可靠的QSAR模型，并详细分析与毒性相关的最有价值模型及其最关键的分子特征。本发明将为设计对发光菌毒性增强或减弱的酚类似物提供有效的理论参考。