一种用于肝癌患者预后风险评估的基因检测试剂盒及应用

    公开(公告)号:CN108611419B

    公开(公告)日:2021-08-03

    申请号:CN201810448563.5

    申请日:2018-05-11

    IPC分类号: C12Q1/6886 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及一种用于肝癌分群和预后风险评估的基因检测试剂盒、数学模型,及其在肝癌分群和预后风险评估中的应用。本发明基于二代测序技术与TCGA(The Cancer Genome Atlas,肿瘤基因组图谱)数据库建立用于肝癌分群及肝癌预后风险评估模型,发现肝癌具有两个明显差异的预后亚群及用于肝癌预后评估的基因群。本发明发现由CA9,CXCL5,G6PD,MMP12,MYBL2和SLC1A5组成的6基因的模型,定义为预后指数PI=exp(p')/exp(1+p'),其中p'=zCA9*1.64+zCXCL5*1.22+zMMP12*1.52+1.93*zMYBL2+0.76*zSLC1A5+2.43*zG6PD‑3.86,该模型可以区分判断不同肝癌预后亚群,反映肝癌患者预后风险。