用于鉴定免疫细胞特别是PD1+细胞的作为表观遗传标志物的PDCD1

    公开(公告)号:CN111212920A

    公开(公告)日:2020-05-29

    申请号:CN201880066521.3

    申请日:2018-10-24

    IPC分类号: C12Q1/6881

    摘要: 本发明涉及一种用于鉴定PD1+细胞的方法,特别是一种体外方法,包括分析哺乳动物的程序性细胞死亡1(PDCD1)基因区中至少一个CpG位置的甲基化状态,其中,与非PD1+细胞相比,所述基因区的去甲基化或缺乏甲基化指示PD1+细胞。根据本发明的分析可以在表观遗传水平上鉴定PD1+细胞,并将其与复杂样品中的所有其他细胞(例如其他血液细胞或免疫细胞)区分开来。本发明还提供了一种用于定量PD1+细胞(特别是在复杂样品中)的改进方法。该方法可以在没有纯化和/或富集细胞的步骤的情况下,优选在全血和/或非胰蛋白酶化组织中进行。

    作为用于鉴定免疫细胞,特别是初始CD8+ T细胞的表观遗传标志物的内皮唾液酸蛋白(CD248)

    公开(公告)号:CN111278988A

    公开(公告)日:2020-06-12

    申请号:CN201880069377.9

    申请日:2018-10-25

    IPC分类号: C12Q1/6876 C12Q1/6881

    摘要: 本发明涉及用于鉴定特异性免疫细胞(特别是初始CD8+ T细胞)的方法(特别是体外方法),其包括分析哺乳动物内皮唾液酸蛋白(CD248)基因区中至少一个CpG位置的甲基化状态,其中当与非初始CD8+ T细胞或任何其它(血液)细胞类型相比时,所述基因区的脱甲基化或甲基化的缺乏指示初始CD8+ T细胞。根据本发明的分析可以在表观遗传水平上鉴定初始CD8+ T细胞,并将它们与复杂样品中的所有其它细胞(如例如其它血液细胞或免疫细胞)区分开。本发明还提供了用于定量初始CD8+ T细胞(特别是在初始CD8+ T细胞复杂样品中的初始CD8+ T细胞)的改进方法。所述方法可以在有或没有纯化和/或富集细胞的步骤的情况下进行,优选在全血和/或非胰蛋白酶消化的组织中进行。

    鉴定生物样品中定量细胞组成的方法

    公开(公告)号:CN107941681B

    公开(公告)日:2021-07-30

    申请号:CN201711262337.X

    申请日:2014-04-22

    IPC分类号: C12Q1/6851

    摘要: 本发明提供了鉴定生物样品中细胞组成的定量、综合性图像的表观遗传血象,又被称为表观遗传血细胞计数,其中有利的是使用了归一化标准物。所述归一化标准物为核酸分子,其包含对待检测的每种血细胞特异的至少一种标志物区域,以及为细胞非特异的至少一种对照区域,其中所述区域以相同拷贝数存在于所述分子和/或已知组成的天然血细胞样品中。此外,本发明涉及实施生物样品的综合性定量细胞组成的表观遗传评估的试剂盒以及试剂盒的用途。所述生物样品来源于,例如哺乳动物体液,包括外周血样品、毛细管血样品或静脉血样品或其亚组分,如外周血单个核细胞或外周血单核细胞,或者组织样品,器官样品,或者来源于冷冻的、干燥的、包埋的、保存的或新鲜的体液或组织样品。

    鉴定生物样品中定量细胞组成的方法

    公开(公告)号:CN105189783B

    公开(公告)日:2020-08-07

    申请号:CN201480016515.9

    申请日:2014-04-22

    摘要: 本发明提供了鉴定生物样品中细胞组成的定量、综合性图像的表观遗传血象,又被称为表观遗传血细胞计数,其中有利的是使用了归一化标准物。所述归一化标准物为核酸分子,其包含对待检测的每种血细胞特异的至少一种标志物区域,以及为细胞非特异的至少一种对照区域,其中所述区域以相同拷贝数存在于所述分子和/或已知组成的天然血细胞样品中。此外,本发明涉及实施生物样品的综合性定量细胞组成的表观遗传评估的试剂盒以及试剂盒的用途。所述生物样品来源于,例如哺乳动物体液,包括外周血样品、毛细管血样品或静脉血样品或其亚组分,如外周血单个核细胞或外周血单核细胞,或者组织样品,器官样品,或者来源于冷冻的、干燥的、包埋的、保存的或新鲜的体液或组织样品。

    鉴定生物样品中定量细胞组成的方法

    公开(公告)号:CN105189783A

    公开(公告)日:2015-12-23

    申请号:CN201480016515.9

    申请日:2014-04-22

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明提供了鉴定生物样品中细胞组成的定量、综合性图像的表观遗传血象,又被称为表观遗传血细胞计数,其中有利的是使用了归一化标准物。所述归一化标准物为核酸分子,其包含对待检测的每种血细胞特异的至少一种标志物区域,以及为细胞非特异的至少一种对照区域,其中所述区域以相同拷贝数存在于所述分子和/或已知组成的天然血细胞样品中。此外,本发明涉及实施生物样品的综合性定量细胞组成的表观遗传评估的试剂盒以及试剂盒的用途。所述生物样品来源于,例如哺乳动物体液,包括外周血样品、毛细管血样品或静脉血样品或其亚组分,如外周血单个核细胞或外周血单核细胞,或者组织样品,器官样品,或者来源于冷冻的、干燥的、包埋的、保存的或新鲜的体液或组织样品。

    用于鉴定免疫细胞特别是嗜碱性粒细胞的作为表观遗传标志物的MCC

    公开(公告)号:CN111295452A

    公开(公告)日:2020-06-16

    申请号:CN201880065699.6

    申请日:2018-10-24

    IPC分类号: C12Q1/6881

    摘要: 本发明涉及一种用于鉴定嗜碱性粒细胞的方法,特别是一种体外方法,包括分析哺乳动物的“结直肠癌突变”(MCC)基因的基因区中至少一个CpG位置的修饰例如甲基化状态,其中,与非嗜碱性粒细胞或外周血或其他组织中的任何其他细胞类型相比,所述基因区的去甲基化或缺乏修饰或甲基化指示嗜碱性粒细胞。根据本发明的分析可以在表观遗传水平上鉴定嗜碱性粒细胞,并将其与复杂样品中的所有其他细胞(例如其他血液细胞或免疫细胞)区分开来。本发明还提供了一种用于定量嗜碱性粒细胞(特别是在复杂样品中)的改进方法。该方法可以在有或没有纯化和/或富集细胞的步骤的情况下,优选在全血和/或非胰蛋白酶化组织中进行。最后,本发明提供了基于亚硫酸氢盐处理的核酸的引物、探针和扩增子。

    PARK2作为用于鉴定免疫细胞特别是单核细胞的表观遗传标志物

    公开(公告)号:CN108026590A

    公开(公告)日:2018-05-11

    申请号:CN201680052663.5

    申请日:2016-09-22

    发明人: 斯文·欧莱克

    IPC分类号: C12Q1/6888

    CPC分类号: C12Q1/6881 C12Q2600/154

    摘要: 本发明涉及用于鉴定单核细胞的方法,特别是体外方法,其包括分析哺乳动物Parkin RBR E3泛素蛋白连接酶(PARK2)的基因区中至少一个CpG位置的甲基化状态,其中当与非单核细胞相比时,所述基因区的去甲基化或缺乏甲基化指示单核细胞。根据本发明的分析可在表观遗传水平上鉴定单核细胞,并在复杂样品(例如其他血液细胞或免疫细胞)中将其与所有其他细胞区分。此外,本发明提供了特别是在复杂样品中定量单核细胞的改进的方法。可在没有纯化和/或富集细胞的步骤情况下,优选在全血和/或未经胰蛋白酶消化的组织中实施所述方法。还要求保护试剂盒以及用作引物或探针的特异性寡核苷酸。

    鉴定生物样品中定量细胞组成的方法

    公开(公告)号:CN107941681A

    公开(公告)日:2018-04-20

    申请号:CN201711262337.X

    申请日:2014-04-22

    IPC分类号: G01N15/14

    摘要: 本发明提供了鉴定生物样品中细胞组成的定量、综合性图像的表观遗传血象,又被称为表观遗传血细胞计数,其中有利的是使用了归一化标准物。所述归一化标准物为核酸分子,其包含对待检测的每种血细胞特异的至少一种标志物区域,以及为细胞非特异的至少一种对照区域,其中所述区域以相同拷贝数存在于所述分子和/或已知组成的天然血细胞样品中。此外,本发明涉及实施生物样品的综合性定量细胞组成的表观遗传评估的试剂盒以及试剂盒的用途。所述生物样品来源于,例如哺乳动物体液,包括外周血样品、毛细管血样品或静脉血样品或其亚组分,如外周血单个核细胞或外周血单核细胞,或者组织样品,器官样品,或者来源于冷冻的、干燥的、包埋的、保存的或新鲜的体液或组织样品。

    作为用于鉴定免疫细胞,特别是单核细胞骨髓源性抑制细胞(mMDSC)的表观遗传标志物的ERGIC1

    公开(公告)号:CN111315896A

    公开(公告)日:2020-06-19

    申请号:CN201880071954.8

    申请日:2018-11-06

    发明人: 斯文·欧莱克

    IPC分类号: C12Q1/6883

    摘要: 本发明涉及用于鉴定特异性免疫细胞(特别是MDSC)的方法(特别是体外方法),其包括分析哺乳动物内质网-高尔基体中间室1(ERGIC1)的基因区中至少一个CpG位置的修饰(优选甲基化状态),其中当与非MDSC比较时,所述基因区的脱甲基化或甲基化或修饰的缺乏指示MDSC。根据本发明的分析可以在表观遗传水平上鉴定MDSC的特异性亚群(即单核细胞MDSC(mMDSC)),并将它们与复杂样品中的所有其它细胞(诸如例如其它血液细胞或免疫细胞)区分开。本发明还提供了用于定量m MDSC(特别是在复杂的样品中的mMDSC)的改进方法。所述方法可以在没有纯化和/或富集细胞的步骤的情况下进行,优选地在全血和/或非胰蛋白酶消化的组织中进行。