一种G蛋白偶联受体药物靶点口袋结构预测方法

    公开(公告)号:CN107220520A

    公开(公告)日:2017-09-29

    申请号:CN201710559083.1

    申请日:2017-07-11

    IPC分类号: G06F19/00

    CPC分类号: G06F19/704 G06F19/706

    摘要: 本发明公开了一种G蛋白偶联受体药物靶点口袋结构预测方法,包括以下步骤:通过平并行不同的运动产生多个初利用RLEX配体对接受体的配体期间模拟界面柔性,通过插入主干扰动阶段来改善界面附近的原子,重组Rosetta标准运动,为界面残基添加配体构象的骨架细化步骤,扩展了RosetttaLigand对接算法。本发明通过集成基于RosettaLigand平台的两种不同的细化协议,提出了通过对接界面的灵活性组合细化(coREF)方法。