公开(公告)号：CN107832577A

公开(公告)日：2018-03-23

申请号：CN201711039627.8

申请日：2017-10-30

申请人： 中国农业大学

发明人： 张莉 ,  董雅雯 ,  袁德凯 ,  凌云

IPC分类号： G06F19/00

CPC分类号： G06F19/706 ,  G06F19/701 ,  G06F19/705 ,  G06F19/707

摘要： 本发明提供了一种筛选几丁质酶OfChtⅠ抑制剂的方法，首先依据类农药性规则在SPECS库中筛选出符合条件的小分子化合物，建立数据库1；并从Protein Data Bank中获取OfCht I与配体共晶的三维结构，比对分析，确定活性口袋；然后根据相互作用分析，建立基于受体的药效团模型，并对数据库1进行筛选，建立数据库2；然后利用分子对接程序，对数据库2中的小分子化合物对接打分，建立数据库3；最后利用软件中的骨架分析模块，将数据库3中的化合物进行骨架分类，得到具有式(I)结构的几丁质酶OfChtⅠ抑制剂；通过研究表明该几丁质酶OfChtⅠ抑制剂对于几丁质酶OfChtⅠ有较好的抑制活性。

公开(公告)号：CN106575320A

公开(公告)日：2017-04-19

申请号：CN201580036059.9

申请日：2015-05-05

申请人： 艾腾怀斯股份有限公司

发明人： A·S·海菲兹 ,  I·瓦拉赫 ,  M·迪萨巴

IPC分类号： G06F19/16 ,  C40B30/02 ,  G01N33/53 ,  G01N33/68 ,  G06F19/10

CPC分类号： G06F19/16 ,  G06F19/24 ,  G06F19/704 ,  G06F19/706 ,  G06F19/707

摘要： 公开了用于预测结合亲和力的系统、装置和方法。存储反映输入数据的记录。构建提供对结合输入特征的几何表示的数据结构。所述数据结构通过编码与至少一种分子和至少一种靶蛋白相关的数据来填充，用于编码的所述数据选自所述存储的输入数据。将预测模型应用于所述数据结构以产生至少一种分子对至少一种靶蛋白的结合亲和力的指示符。

公开(公告)号：CN101792745B

公开(公告)日：2014-09-17

申请号：CN200910077937.8

申请日：2009-02-04

申请人： 中国科学院生物物理研究所

发明人： 刘迎芳 ,  饶子和

IPC分类号： C12N9/00 ,  C07K16/40 ,  A61K39/42 ,  A61K45/00 ,  A61P31/16 ,  C12Q1/25 ,  G01N33/68 ,  C12R1/93

CPC分类号： C07K14/005 ,  C07K2299/00 ,  C12N9/127 ,  C12N2760/16122 ,  C12N2760/16222 ,  C12N2760/16322 ,  C40B30/02 ,  G06F19/16 ,  G06F19/706

摘要： 本发明提供一种流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N的晶体三维结构，其中所述流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端PA_N为所述流感病毒聚合酶亚基PA的从约1～约50位氨基酸至在约150至300位范围内的氨基酸，其中所述晶体三维结构中的原子具有表1中所列的至少40％的原子坐标，或者流感病毒聚合酶亚基PA的氨基端的晶体三维结构中至少40％氨基酸的主链碳骨架的原子结构坐标与表1中的坐标的平均根方差小于或等于1.7埃。本发明还提供对流感病毒聚合酶亚基PA氨基端PA_N的表达、纯化和结晶的方法；以及PA氨基端PA_N的晶体结构及晶体结构在药物筛选及药物设计方面的应用。

公开(公告)号：CN103678752A

公开(公告)日：2014-03-26

申请号：CN201310307193.0

申请日：2013-07-19

申请人： 住友橡胶工业株式会社

发明人： 上野真一

IPC分类号： G06F17/50

CPC分类号： G06F17/5009 ,  B60C1/00 ,  G06F19/701 ,  G06F19/706

摘要： 一种用于模拟聚合物材料的计算机实施方法，包括：对聚合物模型和填料模型进行分子动力学计算的模拟步骤。模拟步骤包括：第一计算步骤，其中在每个聚合物的颗粒之间，定义不限制颗粒间距离的第一耦合势能的条件下，进行分子动力学计算；以及随后的第二计算步骤，其中在每个聚合物的颗粒之间，定义将最大允许颗粒间距离限制为预定值的第二耦合势能P2的条件下，进行分子动力学计算。

公开(公告)号：CN102101886A

公开(公告)日：2011-06-22

申请号：CN200910259339.2

申请日：2009-12-18

申请人： 四川辉阳生命工程股份有限公司

发明人： 魏光文 ,  王大成

IPC分类号： C07K14/555 ,  C07K7/64 ,  G01N33/68 ,  G06F19/00 ,  A61K38/21 ,  A61P31/12 ,  A61P35/00 ,  A61P37/02

CPC分类号： C07K14/555 ,  A61K38/00 ,  C07K14/56 ,  C07K2299/00 ,  G01N2500/04 ,  G06F19/16 ,  G06F19/703 ,  G06F19/706 ,  Y02A50/463 ,  Y02A90/26

摘要： 本发明提供了一种重组干扰素晶体，其具有(i)与人共有干扰素相同的氨基酸序列，以及(ii)与IFN-α2b相比改变了的三维结构。本发明的干扰素具有增强的生物活性。本发明还提供了一种可用于药物筛选和/或药物设计的结构模型。

公开(公告)号：CN101443771A

公开(公告)日：2009-05-27

申请号：CN200580048154.7

申请日：2005-12-16

申请人： 新星筛生物科技公司

发明人： S·佩尔施克 ,  M·刘

IPC分类号： G06F19/00

CPC分类号： G06F19/706 ,  G01N33/6872 ,  G01N2500/00

摘要： 提供促进钾离子通道的调质(特别是HERG通道)的鉴定和表征的材料、方法和计算机系统。

公开(公告)号：CN1207721A

公开(公告)日：1999-02-10

申请号：CN96199615.3

申请日：1996-11-13

申请人： 板井昭子

发明人： 板井昭子 ,  富冈伸夫

IPC分类号： C07B61/00 ,  G06F17/50

CPC分类号： C07B61/00 ,  G06F19/705 ,  G06F19/706

摘要： 使用计算机从含有化合物原子类型及共价键类型信息的数据库中选择可与作为受体的生物体高分子结合的先导候选化合物的方法,该方法包括以下的工序:基于可与生物体高分子结合的1个或2个以上的询问分子定量的、二维的、和/或三维的信息从存储在数据库中的化合物中选择先导候选化合物的工序。询问分子可以通过结构自动构建法构建。不需要庞大的计算,使用通常的个人计算机和工作站等就可以快速地检索出可以结合在生物体高分子上的先导候选化合物。

公开(公告)号：CN104136020B

公开(公告)日：2018-08-28

申请号：CN201380011304.1

申请日：2013-02-27

申请人： 不列颠哥伦比亚癌症局分支机构

发明人： 史蒂文·J·M·琼斯 ,  奥莱克桑德尔·雅克文克 ,  西尔维娅·索伊尼 ,  皮埃尔·尤敏·钟 ,  安江虹

IPC分类号： A61K31/135 ,  A61K31/10 ,  A61K31/167 ,  A61K31/245 ,  A61K31/36 ,  A61K31/407 ,  A61K31/5375 ,  A61P35/00 ,  G01N33/53 ,  G01N33/68

CPC分类号： G06F19/16 ,  A61K31/10 ,  A61K31/135 ,  A61K31/137 ,  A61K31/167 ,  A61K31/245 ,  A61K31/343 ,  A61K31/36 ,  A61K31/407 ,  A61K31/47 ,  A61K31/4709 ,  A61K31/5375 ,  C40B30/02 ,  G06F19/706 ,  Y02A90/26

摘要： 提供了“重编程”表观遗传性标记阅读器或清除器从而识别表观遗传标记而不是它们的内源性(或天然的)标记的方法。重编程阅读器或清除器可以抵消异常的记录器活性(例如，功能缺失或过度活跃)的影响，所述异常的记录器活性可以促进某些疾病状态，诸如癌症。也提供了经这些方法鉴定的重编程的化合物在此类疾病状态的治疗中的用途。可以受这些方法靶向的示例性标记阅读器包括BPTF和CBX2。

公开(公告)号：CN107220520A

公开(公告)日：2017-09-29

申请号：CN201710559083.1

申请日：2017-07-11

申请人： 苏州国利倍康软件科技有限公司

发明人： 吴宏杰 ,  卞恺慧 ,  费振华 ,  陈成

IPC分类号： G06F19/00

CPC分类号： G06F19/704 ,  G06F19/706

摘要： 本发明公开了一种G蛋白偶联受体药物靶点口袋结构预测方法，包括以下步骤：通过平并行不同的运动产生多个初利用RLEX配体对接受体的配体期间模拟界面柔性，通过插入主干扰动阶段来改善界面附近的原子，重组Rosetta标准运动，为界面残基添加配体构象的骨架细化步骤，扩展了RosetttaLigand对接算法。本发明通过集成基于RosettaLigand平台的两种不同的细化协议，提出了通过对接界面的灵活性组合细化(coREF)方法。

公开(公告)号：CN106815486A

公开(公告)日：2017-06-09

申请号：CN201710046416.0

申请日：2017-01-22

申请人： 华中农业大学

发明人： 张红雨 ,  周雄辉 ,  全源 ,  崔泽嘉 ,  杨庆勇

IPC分类号： G06F19/00 ,  G06F19/18 ,  C12Q1/68

CPC分类号： G16H20/10 ,  G06F17/30312 ,  G06F19/20 ,  G16H10/60 ,  G16H50/30 ,  G06F19/706 ,  C12Q1/6883 ,  C12Q2600/136 ,  G06F19/18

摘要： 本发明公开了一种个性化用药的系统药理学方法，本发明使用基因依赖网络刻画在疾病发病过程中基因之间的关系，结合特定病人的基因表达数据，使用能够利用基因间调控关系的基因排序算法来挖掘特定病人发病过程中的关键基因，构建关键基因列表，从而根据药物靶标是否显著地靶向了该特定病人发病过程中的关键基因进行个性化用药。本发明提出的个性化用药的系统药理学方法易于实现、成本低、效率高，在精准医疗和药物发现中具有广泛的应用前景。