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公开(公告)号：CN114078568A
公开(公告)日：2022-02-22
申请号：CN202011355328.7
申请日：2020-11-27
Applicant: 青岛欧易生物科技有限公司 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种基于IIB(2B)型限制性内切酶特征的宏基因组测序数据处理系统，包括：数据预处理模块、定性模块、定量模块和多酶切结果定性/定量合并模块。通过本发明的处理系统可对基于唯一标签的“两步定量法”对具有IIB型限制性内切酶特征的宏基因组测序数据进行分析处理，其具有检测速度快、成本低、假阳性率低、准确率高和分辨率高的特点，为该技术在微生物检测领域打下基础。本发明还公开了基于IIB型限制性内切酶特征的宏基因组测序数据处理方法。本发明所述方法和系统能以低成本、高分辨率实现同时对细菌和真菌等微生物的鉴定和获得相对含量信息，填补目前该技术在微生物简化基因组检测领域上的空白。
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公开(公告)号：CN114078568B
公开(公告)日：2022-07-05
申请号：CN202011355328.7
申请日：2020-11-27
Applicant: 青岛欧易生物科技有限公司 , 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种基于IIB(2B)型限制性内切酶特征的宏基因组测序数据处理系统，包括：数据预处理模块、定性模块、定量模块和多酶切结果定性/定量合并模块。通过本发明的处理系统可对基于唯一标签的“两步定量法”对具有IIB型限制性内切酶特征的宏基因组测序数据进行分析处理，其具有检测速度快、成本低、假阳性率低、准确率高和分辨率高的特点，为该技术在微生物检测领域打下基础。本发明还公开了基于IIB型限制性内切酶特征的宏基因组测序数据处理方法。本发明所述方法和系统能以低成本、高分辨率实现同时对细菌和真菌等微生物的鉴定和获得相对含量信息，填补目前该技术在微生物简化基因组检测领域上的空白。
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公开(公告)号：CN117116351A
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202211296715.7
申请日：2022-10-21
Applicant: 青岛欧易生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于机器学习算法的物种鉴定模型的构建方法，所述方法通过将已知真实物种的高通量测序数据酶切后获得的IIB标签序列与第一微生物唯一标签数据库比对并处理，获得多个基础特征或复合特征，将至少两个基础特征或复合特征构成特征组合，并训练机器学习模型，训练完成后获得物种鉴定模型。本发明还公开了上述构建方法构建获得的物种鉴定模型，以及利用上述物种鉴定模型进行高通量测序物种鉴定的方法以及用于物种鉴定方法的物种鉴定系统。本发明中的方法极大地降低了鉴定的假阳性和假阴性。
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公开(公告)号：CN117116351B
公开(公告)日：2024-02-27
申请号：CN202211296715.7
申请日：2022-10-21
Applicant: 青岛欧易生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于机器学习算法的物种鉴定模型的构建方法，所述方法通过将已知真实物种的高通量测序数据酶切后获得的IIB标签序列与第一微生物唯一标签数据库比对并处理，获得多个基础特征或复合特征，将至少两个基础特征或复合特征构成特征组合，并训练机器学习模型，训练完成后获得物种鉴定模型。本发明还公开了上述构建方法构建获得的物种鉴定模型，以及利用上述物种鉴定模型进行高通量测序物种鉴定的方法以及用于物种鉴定方法的物种鉴定系统。本发明中的方法极大地降低了鉴定的假阳性和假阴性。
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