一种西北春小麦全基因组关联分析方法

    公开(公告)号:CN109545280B

    公开(公告)日:2022-12-06

    申请号:CN201811480751.2

    申请日:2018-12-05

    IPC分类号: G16B20/30

    摘要: 本发明公开了一种西北春小麦全基因组关联分析方法。包括:选择小麦种子种植;成熟期测株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数;成熟后收获种子,测种子粒宽、粒长、重量,计算千粒重;用CTAB法提取DNA,制备DArT芯片;采用STRUCTURE计算小麦品种群体结构,利用贝叶斯模型划分群体结构,采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析,获得与产量和种子特性相关的DArT分子标记;包括12个株高关联标记;2个穗长相关标记;8个小穗数相关标记;3个穗粒数关标记;4个不实小穗数关联标记;3个粒长关联标记;1个千粒重关联标记;4个粒宽关联标记。本发明的DArT分子标记可应用于农业育种中。

    一种西北春小麦性状与标记关联及效应分析的方法

    公开(公告)号:CN109468399A

    公开(公告)日:2019-03-15

    申请号:CN201811481658.3

    申请日:2018-12-05

    IPC分类号: C12Q1/6895 G16B40/00

    摘要: 本发明公开了一种西北春小麦性状与标记关联及效应分析的方法,涉及分子标记领域。包括:选择小麦种子并种植;成熟期测株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数;成熟后收获种子,测定粒宽、粒长、重量,计算千粒重,得到表型数据;利用NSTSYS对农艺性状表型值聚类分析;用CTAB法提取DNA,制备DArT芯片;采用STRUCTURE计算小麦品种群体结构,利用贝叶斯模型划分群体结构,采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析,得到覆盖全基因组的标记数据;将表型数据与覆盖全基因组标记数据进行确定关联位点,获得36个显著相关DArT标记,并明确增效标记与减效标记。本发明的上述DART分子标记可应用于农业育种中。

    一种西北春小麦全基因组关联分析方法

    公开(公告)号:CN109545280A

    公开(公告)日:2019-03-29

    申请号:CN201811480751.2

    申请日:2018-12-05

    IPC分类号: G16B20/30

    摘要: 本发明公开了一种西北春小麦全基因组关联分析方法。包括:选择小麦种子种植;成熟期测株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数;成熟后收获种子,测种子粒宽、粒长、重量,计算千粒重;用CTAB法提取DNA,制备DArT芯片;采用STRUCTURE计算小麦品种群体结构,利用贝叶斯模型划分群体结构,采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析,获得与产量和种子特性相关的DArT分子标记;包括12个株高关联标记;2个穗长相关标记;8个小穗数相关标记;3个穗粒数关标记;4个不实小穗数关联标记;3个粒长关联标记;1个千粒重关联标记;4个粒宽关联标记。本发明的DArT分子标记可应用于农业育种中。