通过信号扩展和数据整合进行的核酸测序

    公开(公告)号:CN1662662A

    公开(公告)日:2005-08-31

    申请号:CN03814178.7

    申请日:2003-05-15

    申请人: 英特尔公司

    发明人: X·苏

    摘要: 在此公开的方法及装置(100)涉及DNA测序。在本发明的一些具体实施方式中,所述方法包括测量标记核苷酸(220)之间的距离,所述核苷酸例如用大体积基团标记。所述方法进一步包括将相同的模板DNA(200)放入四个反应室(110,120,130,140)中,每一个含有不同标记的核苷酸前体,合成互补链(230,240,250)并检测标记核苷酸(220)。标记核苷酸(220)之间的距离可用来构建(450)各种类型标记核苷酸(220)的距离图谱(310,320,330,340)。可比对(520)距离图谱(310,320,330,340)以获得核酸序列(210)。交叠数据分析和频率分析可用来构建(450)距离图谱(310,320,330,340),非交叠数据分析则可用来将所述距离图谱比对成为序列(210)。

    通过信号扩展和数据整合进行的核酸测序

    公开(公告)号:CN1662662B

    公开(公告)日:2012-10-03

    申请号:CN03814178.7

    申请日:2003-05-15

    申请人: 英特尔公司

    发明人: X·苏

    摘要: 在此公开的方法及装置(100)涉及DNA测序。在本发明的一些具体实施方式中,所述方法包括测量标记核苷酸(220)之间的距离,所述核苷酸例如用大体积基团标记。所述方法进一步包括将相同的模板DNA(200)放入四个反应室(110,120,130,140)中,每一个含有不同标记的核苷酸前体,合成互补链(230,240,250)并检测标记核苷酸(220)。标记核苷酸(220)之间的距离可用来构建(450)各种类型标记核苷酸(220)的距离图谱(310,320,330,340)。可比对(520)距离图谱(310,320,330,340)以获得核酸序列(210)。交叠数据分析和频率分析可用来构建(450)距离图谱(310,320,330,340),非交叠数据分析则可用来将所述距离图谱比对成为序列(210)。

    用于病原体和生物物质检测与特性分析的设备及方法

    公开(公告)号:CN1656236A

    公开(公告)日:2005-08-17

    申请号:CN03811868.8

    申请日:2003-05-29

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了检测目标物质的方法与设备。该方法与设备包括提供具有表面的基质,并在其上形成沉积物质的区域。该沉积物质可放置在所述表面并直接和非特异地与该表面结合,或者其可特异地或非特异地与该表面结合。该沉积物质对特定的目标物质具有亲和性。由此产生的区域称为亲和区域或沉积区域。可在单一表面上放置沉积物质的多种亲和区域,制备成多种对应多种目标物质的特异结合亲和区域。目标物质可包括,例如诸如病毒、细菌、细菌孢子、寄生虫、朊病毒、真菌、霉菌、花粉孢子的病原体或病原体标志物。由此产生的设备与怀疑含有一种或多种目标物质的试验溶液、气体或其它支持环境孵育。通过各种方法检测该目标物质与特异亲和区域发生的特异结合相互作用。