公开(公告)号：EP3068883A1

公开(公告)日：2016-09-21

申请号：EP14862125.3

申请日：2014-11-13

申请人： Nugen Technologies, Inc.

发明人： AMORESE, Douglas ,  SCOLNICK, Jonathan ,  SCHROEDER, Ben

IPC分类号： C12N15/11

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2525/179 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2537/157 ,  C12Q2563/179 ,  C12Q2565/514 ,  C12Q2525/155 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2537/159

摘要： The present invention provides methods, compositions and kits for detecting duplicate sequencing reads. In some embodiments, the duplicate sequencing reads are removed.

公开(公告)号：EP3177740A1

公开(公告)日：2017-06-14

申请号：EP15830393.3

申请日：2015-08-06

申请人： Nugen Technologies, Inc.

发明人： SCOLNICK, Jonathan ,  AMORESE, Douglas ,  HUELGA, Stephanie C. ,  SCHROEDER, Benjamin

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C40B30/04 ,  C40B30/00

CPC分类号： G06F19/22 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q1/689 ,  C12Q2600/158 ,  G06F19/28 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2537/165

摘要： Disclosed herein are methods, compositions and kits for quantitating one or more specific nucleic acids within a plurality of nucleic acids. In some embodiments, a sequencing library is constructed from enriched probe extension products specific for the specific nucleic acids and sequenced. In some embodiments, the resulting reads are used for removing duplicate reads. In some embodiments, counting of verified probes is used to quantitate or determine the number of specific nucleic acid molecules in the starting nucleic acid sample.

摘要翻译： 本文公开了用于定量多种核酸内的一种或多种特定核酸的方法，组合物和试剂盒。 在一些实施方案中，测序文库由对特定核酸特异的富集的探针延伸产物构建并测序。 在一些实施例中，所得读取被用于移除重复读取。 在一些实施方案中，使用经验证的探针的计数来定量或确定起始核酸样品中特定核酸分子的数量。