公开(公告)号：JP2016166159A

公开(公告)日：2016-09-15

申请号：JP2015047642

申请日：2015-03-10

Applicant: 桑田 一夫 ,  馬 彪 ,  公益財団法人先端医療振興財団

Inventor： 桑田 一夫 ,  馬 彪

IPC: G06F19/16 ,  C40B30/02

Abstract: 【課題】標的生体分子の活性を制御する化合物の候補をより正確に予測することができるプログラムを提供することを目的とする。 【解決手段】受容体の立体構造を示す立体構造ファイルおよび複数のリガンドの立体構造を示す情報を有する低分子化合物データベースを用いて、受容体と複数のリガンドとの結合エネルギーや結合モデルを算出する第1シミュレーション(DS)を計算機に実行させる第1処理ステップ(S1)と、前記複数のリガンドのうち選択された一のリガンドが受容体にドッキングされたリガンド複合体の一の立体配置を計算する第2シミュレーション(MD)を計算機に実行させる第2処理ステップ(S2)と、当該一の立体配置の量子化学計算を行う第3シミュレーション(QC)を計算機に実行させ、受容体と選択された一のリガンドと相互作用エネルギーとの情報をもつ算出結果を得る第3処理ステップ(S3)とを、含む。 【選択図】図2

Abstract translation: 要解决的问题：提供可以更精确地预测控制目标生物分子的活性的化合物候选的程序。解决方案：程序包括：第一处理步骤（S1），允许计算机执行第一模拟（DS） 通过使用显示受体的三维结构的三维结构文件和具有显示三维结构的信息的低分子化合物数据库来计算受体和多个配体的结合能力或结合模型 多个配体; 第二处理步骤（S2），其允许计算机执行第二模拟（MD），其中将多个配体中选定的一个配体停靠在受体上的配体复合物的一个三维排列; 以及第三处理步骤（S3），其允许计算机执行其中执行一个三维排列的量子化学计算的第三模拟（QC），以获得具有关于受体的信息的计算结果，所选的一个配体和相互作用 能量。选择图：图2

公开(公告)号：JP6353799B2

公开(公告)日：2018-07-04

申请号：JP2015047642

申请日：2015-03-10

Applicant: 桑田 一夫 ,  馬 彪 ,  公益財団法人神戸医療産業都市推進機構

Inventor： 桑田 一夫 ,  馬 彪

IPC: G06F19/16 ,  C40B30/02