公开(公告)号：US07904249B2

公开(公告)日：2011-03-08

申请号：US11982405

申请日：2007-10-31

申请人： Sergey A. Selifonov ,  Willem P. C. Stemmer ,  Claes Gustafsson ,  Matthew Tobin ,  Stephen del Cardayre ,  Phillip A. Patten ,  Jeremy Minshull ,  Lorraine J. Giver

发明人： Sergey A. Selifonov ,  Willem P. C. Stemmer ,  Claes Gustafsson ,  Matthew Tobin ,  Stephen del Cardayre ,  Phillip A. Patten ,  Jeremy Minshull ,  Lorraine J. Giver

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/48 ,  G06G7/58

CPC分类号： G06F19/16 ,  B01J2219/007 ,  C40B50/02 ,  G06F19/14 ,  G06F19/18 ,  G06F19/22 ,  G06F19/24

摘要： In silico nucleic acid recombination methods, related integrated systems utilizing genetic operators are used to identify sets of oligonucleotides for in vitro recombination. In certain embodiments, the methods involve inputting amino acid sequence character strings into a digital system and back-translating the amino acid character strings into a plurality of nucleic acid character strings. The nucleic acid character strings are then processed to define and select at least one recombinant nucleic acid for use in identifying one or more oligonucleotides for in vitro recombination.

摘要翻译： 在计算机核酸重组方法中，利用遗传算子的相关综合系统用于鉴定用于体外重组的寡核苷酸组。 在某些实施方案中，所述方法包括将氨基酸序列字符串输入到数字系统中，并将氨基酸字符串逆向翻译成多个核酸字符串。 然后处理核酸字符串以限定和选择至少一种用于鉴定用于体外重组的一种或多种寡核苷酸的重组核酸。

公开(公告)号：US20110161265A1

公开(公告)日：2011-06-30

申请号：US12979637

申请日：2010-12-28

申请人： Claes Gustafsson ,  Sridhar Govindarajan ,  Robin A. Emig ,  Richard John Fox ,  Ajoy K. Roy ,  Jeremy S. Minshull ,  S. Christopher Davis ,  Anthony R. Cox ,  Phillip A. Patten ,  Linda A. Castle ,  Daniel L. Siehl ,  Rebecca Lynne Gorton ,  Teddy Chen

发明人： Claes Gustafsson ,  Sridhar Govindarajan ,  Robin A. Emig ,  Richard John Fox ,  Ajoy K. Roy ,  Jeremy S. Minshull ,  S. Christopher Davis ,  Anthony R. Cox ,  Phillip A. Patten ,  Linda A. Castle ,  Daniel L. Siehl ,  Rebecca Lynne Gorton ,  Teddy Chen

IPC分类号： G06N3/12 ,  C40B30/02 ,  C40B50/00 ,  G06N5/02

CPC分类号： G06F19/18 ,  C40B30/02 ,  C40B50/02 ,  G06F19/22 ,  G06F19/24

摘要： The present invention generally relates to methods of rapidly and efficiently searching biologically-related data space. More specifically, the invention includes methods of identifying bio-molecules with desired properties, or which are most suitable for acquiring such properties, from complex bio-molecule libraries or sets of such libraries. The invention also provides methods of modeling sequence-activity relationships. As many of the methods are computer-implemented, the invention additionally provides digital systems and software for performing these methods.

摘要翻译： 本发明一般涉及快速有效地搜索生物相关数据空间的方法。 更具体地，本发明包括从复杂的生物分子文库或这些文库集合鉴定具有所需性质或最适合于获得这些性质的生物分子的方法。 本发明还提供了对序列活性关系建模的方法。 由于许多方法是计算机实现的，本发明另外提供用于执行这些方法的数字系统和软件。