公开(公告)号：US20060115841A1

公开(公告)日：2006-06-01

申请号：US11254168

申请日：2005-10-19

申请人： Martin Bluggel ,  Daniel Chamrad ,  Helmut Meyer

发明人： Martin Bluggel ,  Daniel Chamrad ,  Helmut Meyer

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G06F19/00 ,  G01N33/00

CPC分类号： G01N33/6848

摘要： The present invention relates to a method for elucidating the primary structure of biopolymers, in which a biopolymer to be investigated is cleaved into fragments and, after that, subjected to a mass spectrometric analysis (20) resulting in mass spectra being obtained, and in which known algorithms, are used for a first sequence analysis (30) of the fragments in order to determine a primary structure of the biopolymer using the mass spectra. The mass spectra are classified in dependence on results of the first sequence analysis (30), resulting in at least one first spectrum class, to which a known biopolymer can be assigned, and one second spectrum class, to which no known biopolymer can be assigned, being obtained. A further analysis (50) of mass spectra of the second spectrum class is carried out in dependence on the known biopolymer.

摘要翻译： 本发明涉及一种阐明生物聚合物的主要结构的方法，其中将要研究的生物聚合物切割成片段，然后进行质谱分析（20），得到质谱，其中 已知算法用于片段的第一序列分析（30），以便使用质谱确定生物聚合物的一级结构。 质谱根据第一序列分析的结果（30）进行分类，得到至少一个可以分配已知生物聚合物的第一个光谱类别，以及一个第二个光谱类别，未分配已知的生物聚合物 ，获得。 根据已知的生物聚合物进行第二光谱级质谱的进一步分析（50）。

公开(公告)号：US20060188887A1

公开(公告)日：2006-08-24

申请号：US10557501

申请日：2004-05-24

申请人： Martin Bluggel ,  Daniel Chamrad

发明人： Martin Bluggel ,  Daniel Chamrad

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： G16B15/00

摘要： The present invention relates to a method and to a system (100) for predicting the primary structure of biopolymers, especially of proteins and peptides, in which at least two algorithms or the results of at least two algorithms and/or of bioinformatic analyses are combined in order to increase the significance of the results. The system (100) comprises a user interface (UI) for configuring and outputting the results as well as a database interface (DBI) with the databases (DB1, DB2) containing, for example, known amino acid sequences, and with which algorithms for bioinformatic sequences can be actuated.

摘要翻译： 本发明涉及用于预测生物聚合物，特别是蛋白质和肽的生物聚合物的一级结构的方法和系统（100），其中至少两种算法或至少两种算法和/或生物信息学分析的结果相结合 以增加结果的意义。 系统（100）包括用于配置和输出结果的用户界面（UI）以及包含例如已知氨基酸序列的数据库（DB 1，DB 2）的数据库接口（DBI） 可以启动生物信息学序列的算法。