公开(公告)号：US20050079504A1

公开(公告)日：2005-04-14

申请号：US10643049

申请日：2003-08-18

申请人： Mor Amitai ,  Raveh Gill-More ,  Eran Halperin ,  Avner Magen ,  Sarah Pollock

发明人： Mor Amitai ,  Raveh Gill-More ,  Eran Halperin ,  Avner Magen ,  Sarah Pollock

IPC分类号： C12N15/10 ,  G06F19/22 ,  C12Q1/68 ,  G06F19/00 ,  G01N33/48 ,  G01N33/50

CPC分类号： C12N15/1089 ,  C12N15/1034 ,  G16B30/00

摘要： A method of comparing nucleic acid sequences being ESTs included in a first database of sequences and nucleic acid sequences included in a second database of sequences to form groups of sequences from the two databases that all relate to the same gene. For each one or more n-groups of sequences of one of the two databases, associating therewith lists of nucleic acid sequences, each from one of said two databases, each sequence on the list containing the n-groups, and matching sequences on the lists to generate said group.

摘要翻译： 比较包含在序列的第一数据库中的核酸序列和包含在序列的第二数据库中的核酸序列的核酸序列的方法，以形成来自与所述相同基因相关的两个数据库的序列组。 对于两个数据库之一的每个一个或多个n组序列，与其相关联的核酸序列列表，每个来自所述两个数据库中的一个，列表中的每个序列包含n个组，以及列表上的匹配序列 以产生所述组。

公开(公告)号：US06625545B1

公开(公告)日：2003-09-23

申请号：US09133987

申请日：1998-08-13

申请人： Mor Amitai ,  Raveh Avraham Gill-More ,  Eran Halperin ,  Avner Magen ,  Sarah Rachel Pollock

发明人： Mor Amitai ,  Raveh Avraham Gill-More ,  Eran Halperin ,  Avner Magen ,  Sarah Rachel Pollock

IPC分类号： G06F1900

CPC分类号： G06F19/22 ,  C12N15/1034 ,  C12N15/1089

摘要： A method of obtaining an mRNA sequence having alternative spliced variants from a database of ESTs, comprising: providing a raw database comprising a plurality of ESTs; and assembling ones of said ESTs into mRNA sequences, wherein said assembling includes identifying alternative spliced regions.

摘要翻译： 一种从EST数据库获得具有选择性剪接变体的mRNA序列的方法，包括：提供包含多个EST的原始数据库; 将所述EST中的所述EST组装成mRNA序列，其中所述组装包括鉴定可变剪接区。