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    METHOD AND APPARATUS FOR BIOLOGICAL SAMPLE ANALYSIS
    95.
    发明申请
    METHOD AND APPARATUS FOR BIOLOGICAL SAMPLE ANALYSIS 审中-公开
    生物样品分析方法和设备

    公开(公告)号：WO2008067552A3

    公开(公告)日：2008-11-27

    申请号：PCT/US2007086146

    申请日：2007-11-30

    Applicant: FLUIDIGM CORP ,  SUN GANG ,  RAMAKRISHNAN RAMESH ,  JONES ROBERT C

    Inventor： SUN GANG ,  RAMAKRISHNAN RAMESH ,  JONES ROBERT C

    IPC: C12P19/34 ,  G06T11/20

    CPC classification number: C12Q1/686 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2545/114

    Abstract: A method of adjusting amplification curves in a PCR experiment includes receiving a plurality of amplification curves for a sample and computing a first parameter for each of the plurality of amplification curves. The method also includes computing a second parameter for each of the plurality of amplification curves and computing a third parameter using at least a portion of the first or second parameters. The method further includes computing an offset for each of the plurality of amplification curves. The offset is a function of the first parameter and the third parameter. Moreover, the method includes adjusting at least one of the plurality of amplification curves by subtracting the offset.

    Abstract translation: 在PCR实验中调整扩增曲线的方法包括接收样品的多个扩增曲线并且计算多个扩增曲线中的每一个的第一参数。 该方法还包括为多个放大曲线中的每一个计算第二参数并且使用第一或第二参数的至少一部分来计算第三参数。 该方法还包括计算多个扩增曲线中的每一个的偏移。 偏移量是第一个参数和第三个参数的函数。 此外，该方法包括通过减去偏移来调整多个放大曲线中的至少一个。

    癌の診断方法
    98.
    发明申请
    癌の診断方法 审中-公开
    癌症诊断方法

    公开(公告)号：WO2008090930A1

    公开(公告)日：2008-07-31

    申请号：PCT/JP2008/050909

    申请日：2008-01-23

    Applicant: オリンパス株式会社 ,  長岡 智紀

    Inventor： 長岡 智紀

    IPC: G01N33/50 ,  C12N15/09 ,  C12Q1/68

    CPC classification number: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2545/114 ,  C12Q2527/137

    Abstract: 　本発明は、癌細胞由来のＤＮＡを定量して癌の診断を高精度に行う方法の提供に関し、（１）被験者から採取した血漿より遊離ＤＮＡを抽出する工程と、（２）抽出した遊離ＤＮＡを定量して、血漿単位体積あたりの遊離ＤＮＡ含有量を算出して第一の算出値とする工程と、（３）前記第一の算出値を、第一の閾値以上の第二の閾値と比較する工程と、（４）前記第一の算出値が、第一の閾値未満の場合には、被験者が癌に罹患していない可能性が高いと判定し、第一の閾値以上かつ第二の閾値未満の場合には、被験者が癌に罹患している可能性があると判定し、第二の閾値以上の場合には、正常細胞由来のＤＮＡが定量に用いた血漿中に混入していると判定する工程と、を含むことを特徴とする癌の診断方法。

    Abstract translation: 公开了通过确定源自癌细胞的DNA的量来高精度地诊断癌症的方法，其包括以下步骤（1）至（4）：（1）从从受试者收集的血浆中提取游离DNA; （2）确定所提取的游离DNA的量并计算血浆每单位体积的游离DNA含量以获得第一计算值; （3）将第一计算值与等于或高于第一阈值的第二阈值进行比较; 和（4）当所述第一计算值低于所述第一阈值时，确定所述受试者极不可能患有癌症，或者当所述第一计算值等于或等于或确定所述受试者可能患有癌症时 或者当所述第一计算值等于或高于所述第二阈值时，确定用于所述确定的所述血浆被来自正常细胞的DNA污染。

    METHODS AND COMPOSITIONS FOR DETECTING THE PRESENCE OF TARGET NUCLEIC ACIDS IN A SAMPLE
    99.
    发明申请
    METHODS AND COMPOSITIONS FOR DETECTING THE PRESENCE OF TARGET NUCLEIC ACIDS IN A SAMPLE 审中-公开
    用于检测目标核酸在样品中的存在的方法和组合物

    公开(公告)号：WO2004085667A3

    公开(公告)日：2007-11-15

    申请号：PCT/US2004008281

    申请日：2004-03-17

    Applicant: INTERNAT THERAPEUTICS INC ,  KAWASAKI GLENN ,  TRAVIS BRUCE

    Inventor： KAWASAKI GLENN ,  TRAVIS BRUCE

    IPC: C12Q1/68 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C12N15/63 ,  C12P19/34

    CPC classification number: C12Q1/6816 ,  C12Q1/682 ,  C12Q2561/125 ,  C12Q2545/114 ,  C12Q2531/113

    Abstract: Methods and compositions for detecting the presence, e.g., quantitatively, of a target nucleic acid, such as an siRNA, in a sample are provided. In the subject methods, a sample is contacted with at least two different ligation domains, which may be present on separate nucleic acids (e.g., oligonucleotides) or on the same complex, e.g., Combined Oligo, to produce a reaction mixture, where each of the different ligation domains includes a domain complementary to a different region of the target nucleic acid. The ligation domains of any resultant ligation domain/target nucleic acid complexes are then ligated to produce a pseudotarget nucleic acid. The presence of any resultant pseudotarget nucleic acids in the reaction mixture is then determined in order to detect the target nucleic acid in the sample. Also provided are systems and kits that find use in practicing the subject methods. The subject invention finds use in a variety of applications, including therapeutic applications.

    Abstract translation: 提供了用于检测样品中目标核酸如siRNA的定量存在的方法和组合物。 在本主题方法中，将样品与至少两个不同的连接结构域接触，所述连接结构域可以存在于单独的核酸（例如寡核苷酸）上，或者存在于相同的复合物上，例如组合的Oligo上，以产生反应混合物， 不同的连接结构域包括与靶核酸的不同区域互补的结构域。 然后将任何所得连接域/靶核酸复合物的连接结构域连接以产生伪靶核酸。 然后测定反应混合物中任何产生的假靶核酸的存在，以便检测样品中的靶核酸。 还提供了用于实践主题方法的系统和工具包。 本发明可用于各种应用，包括治疗应用。

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