STRUCTURE-BASED DESIGN OF THERAPEUTICS TARGETING RNA HAIRPIN LOOPS

    公开(公告)号:WO2021102153A1

    公开(公告)日:2021-05-27

    申请号:PCT/US2020/061299

    申请日:2020-11-19

    摘要: The invention provides methods and materials that can be used to determine three dimensional structures of RNA hairpin loops and their complexes with inhibitors easily and quickly. The scaffold RNA, YdaO-type c-di-AMP riboswitch from Thermoanaerobacter pseudethanolicus, readily forms crystals with a large cavity over 60 in diameter. A hairpin of interest can be engineered into the P2 stem of this RNA so that the hairpin is accommodated in the cavity. The fusion RNA is then crystallized, and structures can be determined using X-ray or electron crystallography. Embodiments of the invention can be used to identify compounds that bind hairpin loops in order to, for example, effect therapeutic and other biological activities.

    オリゴ核酸化合物の製造方法
    25.
    发明申请

    公开(公告)号:WO2021095875A1

    公开(公告)日:2021-05-20

    申请号:PCT/JP2020/042506

    申请日:2020-11-13

    摘要: 本発明は、一般式[B-1-1]の化合物を一般式[P]の化合物と反応させて、一般式[B-1-2]の化合物を形成させる工程、一般式[B-1-2]の化合物を一般式[A-1]の化合物と反応させて、一般式[C-1-1]の化合物を形成する工程を含む、一般式[C-1-1]の化合物の製造方法に関する。

    化学修飾核酸を導入した安定型標的編集ガイドRNA

    公开(公告)号:WO2020246560A1

    公开(公告)日:2020-12-10

    申请号:PCT/JP2020/022200

    申请日:2020-06-04

    摘要: 標的RNAを特定する第一オリゴヌクレオチドと、第一オリゴヌクレオチドの3'側に連結する第二オリゴヌクレオチドと、第二オリゴヌクレオチドと相補対を形成し得る第三オリゴヌクレオチドと、第二オリゴヌクレオチドと第三オリゴヌクレオチドとを連結する第一連結部とを含み、標的RNAに対する部位特異的編集を誘導するオリゴヌクレオチドである。第一オリゴヌクレオチドは、標的RNA中のアデノシン残基に対応する標的対応ヌクレオチド残基と、標的対応ヌクレオチド残基の5'側に連結し、標的RNAに相補的な塩基配列を有する10から30残基のオリゴヌクレオチドと、標的対応ヌクレオチド残基の3'側に連結し、標的RNAに相補的な塩基配列を有する3から6残基のオリゴヌクレオチドとからなる。第二オリゴヌクレオチドの残基数は5から8であり、第三オリゴヌクレオチドの残基数は5から8である。標的対応ヌクレオチド残基、並びにその3'側及び5'側の各1残基からなるカウンタ領域から選択される少なくとも1残基は、天然型リボヌクレオチド残基以外のヌクレオチド残基である。

    IMPROVED METHODS AND COMPOSITIONS FOR INCREASED DOUBLE STRANDED RNA PRODUCTION

    公开(公告)号:WO2020243593A1

    公开(公告)日:2020-12-03

    申请号:PCT/US2020/035357

    申请日:2020-05-29

    申请人: APSE, INC.

    发明人: KUMAR, Anil

    IPC分类号: A01H3/00 C07H21/02 C12N7/02

    摘要: The invention provides methods and compositions for improved production of large quantities of unencapsidated double strand RNA (dsRNA) in vivo. The disclosed methods and compositions, comprising co-expression of genes encoding orotate phosporibosyl transferase, bacteriophage coat protein and dsRNA produce a significant improvement over current in vivo methods of producing unencapsidated dsRNA.