公开(公告)号：WO2010107113A1

公开(公告)日：2010-09-23

申请号：PCT/JP2010/054797

申请日：2010-03-19

Applicant: 国立大学法人東京工業大学 ,  相澤 康則 ,  東野 真之 ,  石黒 光一

Inventor： 相澤　康則 ,  東野　真之 ,  石黒　光一

IPC: C12N15/09 ,  C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/686 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2535/113 ,  C12Q2521/301

Abstract: 　網羅性及び迅速性の高いレトロエレメント多型検出手段を提供することを目的として、レトロエレメントによって生じた多型を検出する方法であって、以下の（１）～（５）の工程を含むことを特徴とする多型の検出方法を提供する、（１）多型の検出対象とする複数のゲノムDNAを、ゲノムDNAごとに、レトロエレメント内部に少なくとも一つの切断部位を持つ制限酵素で処理する工程、（２）制限酵素によって切断されたDNA断片を自己環化させる工程、（３）自己環化させたDNA断片を鋳型としてインバースPCRを行う工程、（４）増幅されたDNA断片のレトロエレメントの周辺配列の塩基配列を決定する工程、（５）決定したレトロエレメントの周辺配列を、多型の検出対象とするゲノムDNA間で比較、又はデータベース上のゲノムDNAと比較し、特定のゲノムDNAに含まれていたレトロエレメントの周辺配列を検出する工程。

Abstract translation: 为了提供高度全面和快速的逆转录多态性检测手段，公开了一种逆转录诱导多态性的检测方法，其特征在于包括以下步骤1-5。1）对于多个基因组DNA中的每个基因组DNA片段， 作为多态性检测对象的片段，使用限制酶处理DNA，所述限制酶具有至少在逆转录病毒中发生一次的切割位点。 2）使限制酶切割的DNA片段自环化的步骤。 3）以自环化DNA片段为模板进行反向PCR的步骤。 4）确定扩增的DNA片段中逆转子侧翼的碱基序列的步骤。 5）检测在多态性检测对象基因组DNA片段或数据库中的基因组DNA之间比较确定的逆转录侧翼序列和基因组DNA的特定片段中的逆转录侧翼序列的步骤。