公开(公告)号：WO2010002883A3

公开(公告)日：2010-01-07

申请号：PCT/US2009/049244

申请日：2009-06-30

Applicant: BIONANOMATRIX, INC. ,  XIAO, Ming ,  DESHPANDE, Parikshit, A. ,  CAO, Han ,  AUSTIN, Michael ,  VIJAYAN, Kandaswamy ,  SHARONOV, Alexey, Y. ,  BOYCE-JACINO, Michael

Inventor： XIAO, Ming ,  DESHPANDE, Parikshit, A. ,  CAO, Han ,  AUSTIN, Michael ,  VIJAYAN, Kandaswamy ,  SHARONOV, Alexey, Y. ,  BOYCE-JACINO, Michael

IPC: C12Q1/68

Abstract: Provided are methods and devices for single-molecule genomic analysis. In one embodiment, the methods entail processing a double-stranded nucleic acid and characterizing said nucleic acid. These methods are useful in, e.g., determining structural variations and copy number variations between individuals.

公开(公告)号：WO2010002883A2

公开(公告)日：2010-01-07

申请号：PCT/US2009049244

申请日：2009-06-30

Applicant: BIONANOMATRIX INC ,  XIAO MING ,  DESHPANDE PARIKSHIT A ,  CAO HAN ,  AUSTIN MICHAEL ,  VIJAYAN KANDASWAMY ,  SHARONOV ALEXEY Y ,  BOYCE-JACINO MICHAEL

Inventor： XIAO MING ,  DESHPANDE PARIKSHIT A ,  CAO HAN ,  AUSTIN MICHAEL ,  VIJAYAN KANDASWAMY ,  SHARONOV ALEXEY Y ,  BOYCE-JACINO MICHAEL

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6818 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6825 ,  C12Q1/6869 ,  G06F19/18 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2565/1015 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2537/1376 ,  C12Q2561/109 ,  C12Q2565/1025 ,  C12Q2565/631

Abstract: Provided are methods and devices for single-molecule genomic analysis. In one embodiment, the methods entail processing a double-stranded nucleic acid and characterizing said nucleic acid. These methods are useful in, e.g., determining structural variations and copy number variations between individuals.

Abstract translation: 提供单分子基因组分析的方法和装置。 在一个实施方案中，所述方法需要处理双链核酸并表征所述核酸。 这些方法在例如确定个体之间的结构变化和拷贝数变化方面是有用的。

公开(公告)号：WO2013063382A3

公开(公告)日：2013-10-10

申请号：PCT/US2012062105

申请日：2012-10-26

Applicant: ILLUMINA INC ,  BOWEN M SHANE ,  GUNDERSON KEVIN L ,  LIN SHENGRONG ,  BACIGALUPO MARIA CANDELARIA ROGERT ,  VIJAYAN KANDASWAMY ,  WU YIR-SHYUAN ,  VENKATESAN BALA MURALI ,  TSAY JAMES ,  BEIERLE JOHN M ,  BERTI LORENZO ,  PARK SANG RYUL

Inventor： BOWEN M SHANE ,  GUNDERSON KEVIN L ,  LIN SHENGRONG ,  BACIGALUPO MARIA CANDELARIA ROGERT ,  VIJAYAN KANDASWAMY ,  WU YIR-SHYUAN ,  VENKATESAN BALA MURALI ,  TSAY JAMES ,  BEIERLE JOHN M ,  BERTI LORENZO ,  PARK SANG RYUL

IPC: B01J19/00 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/543

CPC classification number: C12Q1/6844 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00621 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00641 ,  B01J2219/00644 ,  B01J2219/00648 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00662 ,  B01J2219/00722 ,  B01J2219/00788 ,  C12Q1/686 ,  C40B50/18 ,  C12Q2527/125 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2565/543

Abstract: A microarray is designed capture one or more molecules of interest at each of a plurality of sites on a substrate. The sites comprise base pads, such as polymer base pads, that promote the attachment of the molecules at the sites. The microarray may be made by one or more patterning techniques to create a layout of base pads in a desired pattern. Further, the microarrays may include features to encourage clonality at the sites.

Abstract translation: 微阵列被设计为在基底上的多个位点中的每一个处捕获一个或多个感兴趣的分子。 这些位点包含基垫，例如聚合物基垫，其促进分子在该位点处的附着。 微阵列可以通过一种或多种图案化技术制成，以便以期望的图案形成基垫的布局。 此外，微阵列可以包括鼓励在该位点克隆的特征。

公开(公告)号：WO2013063382A2

公开(公告)日：2013-05-02

申请号：PCT/US2012/062105

申请日：2012-10-26

Applicant: ILLUMINA, INC. ,  BOWEN, M. Shane ,  GUNDERSON, Kevin L. ,  LIN, Shengrong ,  BACIGALUPO, Maria Candelaria Rogert ,  VIJAYAN, Kandaswamy ,  WU, Yir-Shyuan ,  VENKATESAN, Bala Murali ,  TSAY, James ,  BEIERLE, John M. ,  BERTI, Lorenzo ,  PARK, Sang Ryul

Inventor： BOWEN, M. Shane ,  GUNDERSON, Kevin L. ,  LIN, Shengrong ,  BACIGALUPO, Maria Candelaria Rogert ,  VIJAYAN, Kandaswamy ,  WU, Yir-Shyuan ,  VENKATESAN, Bala Murali ,  TSAY, James ,  BEIERLE, John M. ,  BERTI, Lorenzo ,  PARK, Sang Ryul

IPC: B01J19/00

CPC classification number: C12Q1/6844 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00621 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00641 ,  B01J2219/00644 ,  B01J2219/00648 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00662 ,  B01J2219/00722 ,  B01J2219/00788 ,  C12Q1/686 ,  C40B50/18 ,  C12Q2527/125 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2565/543

Abstract: A microarray is designed capture one or more molecules of interest at each of a plurality of sites on a substrate. The sites comprise base pads, such as polymer base pads, that promote the attachment of the molecules at the sites. The microarray may be made by one or more patterning techniques to create a layout of base pads in a desired pattern. Further, the microarrays may include features to encourage clonality at the sites.

Abstract translation: 设计的微阵列在基底上的多个位点的每一个处捕获一个或多个感兴趣的分子。 这些部位包括促进分子在部位附着的基底垫，例如聚合物基底垫。 微阵列可以通过一种或多种图案化技术制成，以产生所需图案的基底布局。 此外，微阵列可以包括在站点鼓励克隆性的特征。