公开(公告)号：WO2013063519A1

公开(公告)日：2013-05-02

申请号：PCT/US2012/062295

申请日：2012-10-26

Applicant: ASURAGEN, INC. ,  JOHNS HOPKINS UNIVERSITY

Inventor： ADAI, Alex, T. ,  SZAFRANSKA-SCHWARZBACH, Anna, E. ,  ANDRUSS, Bernard, F. ,  MAITRA, Anirban ,  MATTHAEI, Hanno ,  WYLIE, Dennis ,  HRUBAN, Ralph

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6837 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/158 ,  C12Q2600/178 ,  G16H50/30

Abstract: Embodiments concern methods and compositions for evaluating a pancreatic cyst in a patient based on the expression levels of one or more miRNAs to determine whether the pancreatic cyst is a low or high risk lesion and in further need of treatment such as resection.

Abstract translation: 实施方案涉及基于一种或多种miRNA的表达水平来评估患者胰腺囊肿的方法和组合物，以确定胰腺囊肿是低风险或高风险病变，还需要进一步治疗如切除。

公开(公告)号：WO2013063544A1

公开(公告)日：2013-05-02

申请号：PCT/US2012/062330

申请日：2012-10-27

Applicant: ASURAGEN, INC.

Inventor： BEAUDENON-HUIBREGTSE, Sylvie ,  WYLIE, Dennis ,  ADAI, Alex, T.

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q2600/158 ,  C12Q2600/178

Abstract: Embodiments concern methods and compositions for distinguishing benign from malignant thyroid tumors in a patient based on the expression levels of one or more miRNAs.

Abstract translation: 实施方案涉及基于一种或多种miRNA的表达水平来区分患者中良性和恶性甲状腺肿瘤的方法和组合物。

公开(公告)号：WO2014055117A1

公开(公告)日：2014-04-10

申请号：PCT/US2013/030990

申请日：2013-03-13

Applicant: ASURAGEN, INC.

Inventor： WYLIE, Dennis ,  SCHWARZBACH, Anna ,  ANDRUSS, Bernard ,  ADAI, Alex ,  LEE, Linda, S. ,  CONWELL, Darwin, L.

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/158 ,  C12Q2600/178

Abstract: Embodiments concern methods and compositions for characterizing or evaluating neoplastic pancreatic cells using miRNAs that are measured and used in calculations to determine a risk score for a patient. The pancreatic cells may be characterized as mucinous cystic neoplasm (MCN), serous cystadenoma (SN), pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), intraductal papillary mucinous neoplasm (IPMN) or a subtype thereof. Benign cells may be distinguished from pre-malignant or malignant pancreatic cells.

Abstract translation: 实施方案涉及使用miRNA进行表征或评估肿瘤性胰腺细胞的方法和组合物，所述miRNA用于测量并用于计算以确定患者的风险评分。 胰腺细胞可以表征为粘液性囊性肿瘤（MCN），浆液性囊腺瘤（SN），胰腺导管腺癌（PDAC），导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）或其亚型。 良性细胞可以与恶性前或恶性胰腺细胞区分开来。

公开(公告)号：WO2016138376A1

公开(公告)日：2016-09-01

申请号：PCT/US2016/019766

申请日：2016-02-26

Applicant: ASURAGEN, INC.

Inventor： ZEIGLER, Robert ,  WYLIE, Dennis ,  HAYNES, Brian ,  LATHAM, Gary

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6827 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6869 ,  G06F19/18 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2537/143 ,  C12Q2545/114 ,  C12Q2563/149

Abstract: Embodiments are provided that relate to methods, systems, kits, computer-readable medium, and apparatuses comprising a computer-based variant calling model that incorporates the viable template count of the aliquot in calling a sequence of a target region based on a set of sequence reads.

Abstract translation: 提供了涉及方法，系统，套件，计算机可读介质和包括基于计算机的变体调用模型的装置，该模型包括基于一组序列调用目标区域的序列的等分试样的可行模板计数 读取。