1. 一种大菱鲆家系育种值评估方法

申请号: CN201410148388.X

申请日: 2014-04-14

公开(公告)号: CN103882144B

公开(公告)日: 2016-01-20

发明人: 王伟继; 官健涛; 胡玉龙; 栾生; 孔杰

一种大菱鲆家系育种值评估方法,本发明属于海水动物遗传育种领域,它包括大菱鲆家系构建、家系个体数据采集与DNA提取、微卫星位点基因分型和数据处理;相比于依靠物理系谱评估育种值的方法,本方法能提高个体间亲缘系数准确度,在育种值预测及其准确度方面发挥优势。以此更好的指导选育工作。

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2. 一种大菱鲆个体育种值评估方法

申请号: CN201410514807.7

申请日: 2014-09-30

公开(公告)号: CN104313135B

公开(公告)日: 2015-07-01

发明人: 王伟继; 官健涛; 胡玉龙; 栾生; 孔杰

本发明的目的是提供一种大菱鲆个体育种值评估方法,以解决利用背景来源不明、物理系谱残缺、或者利用引进的大菱鲆群体进行良种选育时,无法利用物理系谱信息推算出个体亲缘系数,从而不能进行个体遗传参数评估的问题,从而弥补现有技术的不足。相比于依靠物理系谱评估育种值的方法,本方法的方法能够大幅节约个体育种值评估的时间期限,即无需经过多代培育家系材料等繁琐步骤,只需一代即可完成个体育种值评估。

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3. 一种大菱鲆家系育种值评估方法

申请号: CN201410148388.X

申请日: 2014-04-14

公开(公告)号: CN103882144A

公开(公告)日: 2014-06-25

发明人: 王伟继; 官健涛; 胡玉龙; 栾生; 孔杰

一种大菱鲆家系育种值评估方法,本发明属于海水动物遗传育种领域,它包括大菱鲆家系构建、家系个体数据采集与DNA提取、微卫星位点基因分型和数据处理;相比于依靠物理系谱评估育种值的方法,本方法能提高个体间亲缘系数准确度,在育种值预测及其准确度方面发挥优势。以此更好的指导选育工作。

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4. 一种大菱鲆个体育种值评估方法

申请号: CN201410514807.7

申请日: 2014-09-30

公开(公告)号: CN104313135A

公开(公告)日: 2015-01-28

发明人: 王伟继; 官健涛; 胡玉龙; 栾生; 孔杰

本发明的目的是提供一种大菱鲆个体育种值评估方法,以解决利用背景来源不明、物理系谱残缺、或者利用引进的大菱鲆群体进行良种选育时,无法利用物理系谱信息推算出个体亲缘系数,从而不能进行个体遗传参数评估的问题,从而弥补现有技术的不足。相比于依靠物理系谱评估育种值的方法,本方法的方法能够大幅节约个体育种值评估的时间期限,即无需经过多代培育家系材料等繁琐步骤,只需一代即可完成个体育种值评估。

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5. 一种动植物育种值预测方法及装置

申请号: CN202110169023.5

申请日: 2021-02-07

公开(公告)号: CN112837750A

公开(公告)日: 2021-05-25

发明人: 苗泽圃; 陈涛; 杨漫漫; 李斌; 李勇; 魏强

本发明公开了一种动植物育种值预测方法及装置,属于育种值预测领域,在获取到基因组后,对基因组进行单核苷酸多态性标记,然后获取每个染色体的标记,对每个染色体的标记构建中间矩阵,合并所有中间矩阵得到基因组的亲缘矩阵,然后由亲缘矩阵计算得到第一育种值,之后根据第一育种值为每个染色体的标记构建权重中间矩阵,由权重中间矩阵得到基因组的加权亲缘矩阵,最后根据加权亲缘矩阵计算得到最终的育种值。本申请方案提供的预测方法,在计算得到第一育种值之后,根据第一育种值对每个染色体的标记进行加权,无需假定所有标记都存在效应,有效利用高密度标记信息,提高了最终育种值的准确率,计算过程简单,降低了预测时间和计算成本。

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6. 一种泥蚶肥满度育种值的测定方法

申请号: CN201910896214.4

申请日: 2019-09-22

公开(公告)号: CN110631952A

公开(公告)日: 2019-12-31

发明人: 柴雪良; 任鹏; 何俊; 李宗涵

本发明公开了一种泥蚶肥满度育种值的测定方法,其技术方案要点包括如下步骤:步骤一,泥蚶称重;步骤二,天平去平;步骤三,浮力测算;步骤四,数据记录;步骤五,育种计算:通过物体在水中受到的浮力等于排出水的体积,即得到测定对象的体积Vn=V排=Fn/(ρ×g),再通过育种测算公式进行计算,泥蚶肥满度育种值等于(1.85-Mn/Vn)/0.4*100。本发明通过测量泥蚶的个体密度来间接反映其肥满度,并将个体密度转化为育种值,再通过育种值反映个体肥满度的性状,具有便于泥蚶性状选育工作的进行,在测定过程不会导致泥蚶死亡又能反映其肥满度的效果。

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7. 一种动植物育种值预测方法及装置

申请号: CN202110169023.5

申请日: 2021-02-07

公开(公告)号: CN112837750B

公开(公告)日: 2024-06-21

发明人: 苗泽圃; 陈涛; 杨漫漫; 李斌; 李勇; 魏强

本发明公开了一种动植物育种值预测方法及装置,属于育种值预测领域,在获取到基因组后,对基因组进行单核苷酸多态性标记,然后获取每个染色体的标记,对每个染色体的标记构建中间矩阵,合并所有中间矩阵得到基因组的亲缘矩阵,然后由亲缘矩阵计算得到第一育种值,之后根据第一育种值为每个染色体的标记构建权重中间矩阵,由权重中间矩阵得到基因组的加权亲缘矩阵,最后根据加权亲缘矩阵计算得到最终的育种值。本申请方案提供的预测方法,在计算得到第一育种值之后,根据第一育种值对每个染色体的标记进行加权,无需假定所有标记都存在效应,有效利用高密度标记信息,提高了最终育种值的准确率,计算过程简单,降低了预测时间和计算成本。

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8. 一种估计基因组育种值的方法及装置

申请号: CN201710651753.2

申请日: 2017-08-02

公开(公告)号: CN107563147B

公开(公告)日: 2019-12-20

发明人: 刘剑锋; 康慧敏; 宁超; 张胜利

本发明实施例提供一种估计基因组育种值的方法及装置,该方法包括:根据矩阵M‑1的子块数和预设的MPI进程数n,确定MPI进程MPIi读取的根据表型数据文件的记录条数、矩阵A‑1中的个体数和所述MPI进程数n,确定MPI进程MPIi读取的系数矩阵Wi和根据MPI进程MPIi的系数矩阵Wi和确定待估计的基因组育种值。本发明实施例可以实现计算机资源与运算速度的最优化,节约运算时间,提高工作效率。

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9. 一种育种科研成果应用价值评价方法

申请号: CN202011473225.0

申请日: 2020-12-11

公开(公告)号: CN112488571A

公开(公告)日: 2021-03-12

发明人: 曹艳; 雷波; 胡亮; 刘永波; 唐江云

本发明公开了一种育种科研成果应用价值评价方法,包括录入科研成果的相关信息;通过所述相关信息转化成技术指标、市场指标和风险指标;根据所述协同度构建应用价值评价指标体系,并通过计算模块计算科研成果的价值指数;根据所述应用价值评价模型得出分析结果并通过专家评估值作为权重值将结果输出风险评估值,最后得出结论.本发明有助于科研单位提高自身的效率,有效的使用有限的育种,并根据生产需要进行研发,促进科研成果或者科研单位之间经济效益的比较,从而优化宏观育种的配置,为推广决策服务。

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10. 一种估计基因组育种值的方法及装置

申请号: CN201710651753.2

申请日: 2017-08-02

公开(公告)号: CN107563147A

公开(公告)日: 2018-01-09

发明人: 刘剑锋; 康慧敏; 宁超; 张胜利

本发明实施例提供一种估计基因组育种值的方法及装置,该方法包括:根据矩阵M-1的子块数和预设的MPI进程数n,确定MPI进程MPIi读取的 根据表型数据文件的记录条数、矩阵A-1中的个体数和所述MPI进程数n,确定MPI进程MPIi读取的系数矩阵Wi和 根据MPI进程MPIi的 系数矩阵Wi和确定待估计的基因组育种值。本发明实施例可以实现计算机资源与运算速度的最优化,节约运算时间,提高工作效率。

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11. 一种快速筛选高碱消值育种材料的方法

申请号: CN202411157523.7

申请日: 2024-08-22

公开(公告)号: CN118923530A

公开(公告)日: 2024-11-12

发明人: 李恒进; 韩冬; 江青山; 陈家彬; 姜方洪; 邬相宏; 王峰

本发明公开了一种快速筛选高碱消值育种材料的方法,涉及稻米育种技术领域,包括以下步骤:S1、选株,在育种田中,根据预设育种目标选取目标单株,收回后进行自然晾干处理;S2、脱粒与加工,对每个所述目标单株进行独立脱粒,从脱粒后的谷粒中随机选取30粒进行初步筛选;S3、质量评价:对糙米样本进行品质评估;S4、碱消值测定,对于每个选定的糙米样本,随机选择6粒进行碱消值的测定;S5、数据分析与决策,对12粒检测的糙米碱消值进行分析。本发明为一种快速筛选高碱消值育种材料的方法,通过。

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12. 一种快速估计基因组育种值的方法和应用

申请号: CN201410067415.0

申请日: 2014-02-26

公开(公告)号: CN103914632A

公开(公告)日: 2014-07-09

发明人: 丁向东; 李秀金; 张勤; 王胜

本发明属于生物信息学领域,提供了一种快速估计基因组育种值的方法,包括SNP芯片数据编辑;整理系谱文件;利用系谱信息构建A阵,从A阵中挑出具有SNP基因型的个体,根据个体间A阵元素构建子矩阵A22;利用高密度SNP芯片信息构建G阵,利用公共开源LAPACK数学库中DGEMM过程快速构建G阵;构建H矩阵,调用公共开源LAPACK数学库中DGETRF和DGETRI矩阵求逆子程序,快速求得A阵、A22阵以及G阵的逆矩阵,进而根据以上分块逆矩阵求解H逆矩阵;通过混合模型方程组求解个体的基因组育种值。本方法加快了利用综合系谱信息和基因组信息估计基因组育种值的计算速度,可推进基因组选择在动物育种领域的应用。

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13. 一种估计基因组育种值的方法、装置及系统

申请号: CN202110037193.8

申请日: 2021-01-12

公开(公告)号: CN112712852A

公开(公告)日: 2021-04-27

发明人: 苗泽圃; 李勇; 杨漫漫; 沈俊燃; 王然; 韩虎

本申请涉及一种估计基因组育种值的方法、装置及系统,估计基因组育种值的方法包括:获取高密度的全基因组分子标记;对全基因组分子标记进行修剪,得到第一基因组分子标记;利用第一基因组分子标记构建亲缘关系矩阵;利用亲缘关系矩阵对全基因组分子标记进行全基因组关联分析,筛选出性状相关标记;针对中遗传力和低遗传力性状,将第一基因组分子标记和性状相关标记进行合并,并基于第一混合模型方程组得到育种值;针对高遗传力的性状,将第一基因组分子标记与性状相关标记作为具有不同遗传方差的两个组分,并基于第二混合模型方程组得到育种值。如此,提高了计算效率,减少了计算资源的消耗,提高了基因组选择准确性,能够加快动植物遗传改良。

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14. 一种高育种价值的水稻叶色突变基因及应用

申请号: CN201810258873.0

申请日: 2018-03-27

公开(公告)号: CN108265037A

公开(公告)日: 2018-07-10

发明人: 万建民; 赵志刚; 郑海; 王卓然; 王超龙; 余晓文; 江玲; 刘世家; 刘喜; 陈亮明; 田云录

本发明提供一种高育种价值的水稻叶色突变体基因OsBH6,其cDNA序列如SEQ ID NO.1所示,为甘氨酰tRNA合成酶基因ORF16在第1346个碱基处由T到A的单碱基突变,该突变发生在基因ORF16第六个外显子上,导致表达蛋白的第217个氨基酸由异亮氨酸变为赖氨酸,表现为致死型。通过检测本发明所述突变基因OsBH6,可以发现潜在的白化幼苗隐性基因,对于白化幼苗的基因检测和水稻育种具有重要的意义。

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15. 一种改良绿絮棉衣分与马克隆值的育种方法

申请号: CN201310256195.1

申请日: 2013-06-26

公开(公告)号: CN103392587A

公开(公告)日: 2013-11-20

发明人: 陈旭升; 狄佳春

本发明涉及一种提高绿絮棉衣分与马克隆值的育种方法,属于农业品种选育技术领域。用普通绿絮棉为亲本与衣分40%以上、马克隆值6.0以上,其他综合农艺性状比较优良的白棉父本进行1轮或2轮杂交转育;分离世代选择具有衣分在30%以上、马克隆值在3.0-4.5之间、絮色为绿的单株,通过繁殖纯化,即获得提高绿絮棉衣分与马克隆值的新材料。本发明通过提高绿絮棉纤维的马克隆值与衣分,不但提高了绿絮棉的综合纤维品质与皮棉产量;同时也使绿絮棉纤维的色彩稳定性得到一定程度的改善。

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16. 一种奶牛个体基因组育种值评估方法及系统

申请号: CN202410506514.8

申请日: 2024-04-25

公开(公告)号: CN118326053A

公开(公告)日: 2024-07-12

发明人: 彭夏雨; 魏勇; 陈磊; 李智星

本发明提供一种奶牛个体基因组育种值评估方法及系统,涉及基因组育种值评估技术领域,具体步骤包括:通过DNA测序技术对奶牛基因组进行测序,采集N组奶牛个体基因组的相关参数,基因组的相关参数包括单核苷酸多态性位点的数量和杂合度,采集N组奶牛个体的遗传参数,所述遗传参数包括生产性状、生长性状和健康性状。本发明可以全面地评估奶牛个体的育种价值,避免单一指标评估带来的片面性,可以通过构建预测模型,根据奶牛个体的遗传参数和生产性状等数据,预测其育种潜力,还可以将奶牛个体的育种实际值与种群平均值进行比较,可以判断其遗传优势,有助于更好地了解每个个体在整个种群中的优势和劣势,有针对性地进行育种和选配。

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17. 一种估计基因组育种值的方法、装置及系统

申请号: CN202110037193.8

申请日: 2021-01-12

公开(公告)号: CN112712852B

公开(公告)日: 2024-06-21

发明人: 苗泽圃; 李勇; 杨漫漫; 沈俊燃; 王然; 韩虎

本申请涉及一种估计基因组育种值的方法、装置及系统,估计基因组育种值的方法包括:获取高密度的全基因组分子标记;对全基因组分子标记进行修剪,得到第一基因组分子标记;利用第一基因组分子标记构建亲缘关系矩阵;利用亲缘关系矩阵对全基因组分子标记进行全基因组关联分析,筛选出性状相关标记;针对中遗传力和低遗传力性状,将第一基因组分子标记和性状相关标记进行合并,并基于第一混合模型方程组得到育种值;针对高遗传力的性状,将第一基因组分子标记与性状相关标记作为具有不同遗传方差的两个组分,并基于第二混合模型方程组得到育种值。如此,提高了计算效率,减少了计算资源的消耗,提高了基因组选择准确性,能够加快动植物遗传改良。

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18. 一种整合显性效应的基因组育种值估计方法

申请号: CN201810997830.4

申请日: 2018-08-29

公开(公告)号: CN109101786B

公开(公告)日: 2021-02-09

发明人: 刘天飞; 瞿浩; 罗成龙; 王艳; 计坚; 舒鼎铭

本发明公开一种整合显性效应的基因组育种值估计方法,涉及畜禽遗传选育技术领域。该方法包括确定参考群体和候选群体、参考群体目标性状表型测定获取、参考群体全基因组标记分型、参考群体基因标记质量控制、参考群体杂合标记偏离幅度统计、基因组标记重新编码规则制定、候选群体全基因组标记分型、候选群体基因标记质量控制、基因组标记重新编码和估计基因组育种值等步骤。本发明基于杂合基因型表型与纯合基因型表型的偏离程度,制定编码规则,从基因组标记端着手,重新编码杂合基因型,使基因标记编码包含显性效应,然后估计基因组育种值。本发明适应畜禽遗传选育需求,能够不增加模型复杂度的同时大幅提高基因组估计育种值准确性。

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