本发明一种四机三总线冗余异构GNC系统包括：飞控计算机、敏感器、执行机构和1553B总线；GNC系统配置三条1553B总线，完成导航信息及控制指令的传输，实现飞控计算机与敏感器及执行机构的信息交互；采用四机冗余的飞控计算机进行全系统导航信息处理及制导控制指令的发出；采用双冗余或三冗余敏感器完成航天器全任务段信息采集；采用三冗余执行机构完成飞控计算机发出的控制指令。本发明能够满足系统在全任务周期内的实时性、容错性和可靠性要求。