本发明提供了一种米根霉糖化酶的淀粉结合域突变体、该突变体与有机磷农药降解酶的融合酶、制备方法及其在农药废水处理中的应用。通过分析大量淀粉结合域的结合位点，获得多个结合位点突变体，结果发现突变体SBDm(S33T,F58W)具有优良的作为亲和标签结合淀粉基质的性能。将该突变体SBDm与有机磷农药降解酶(OP)融合，可一步快速将有机磷农药降解酶从发酵液中固定在淀粉基质上，而亲和标签和固定化并不影响酶活性。淀粉基质固定化后的降解酶在有机磷农药生产废水处理和其它农药残留去除方面具有很大的应用前景。