本发明公开了一种能够显著抑制结直肠癌发生的两歧双歧杆菌(Bifidobacterium bifidum)及其用途，属于微生物技术领域。本发明提供的两歧双岐杆菌HNJ6，其保藏编号为GDMCC No.60255，能耐受胃酸和胆盐，能够显著地减轻结直肠癌模型小鼠结直肠部位的炎症反应，通过调节结直肠组织中Notch1、Notch2信号通路及VEGFR2分子的表达，减少模型小鼠结、直肠部位的肿瘤数量。此外，两歧双歧杆菌HNJ6还可以改善肠道菌群结构和肠道内短链脂肪酸水平。所述的两歧双歧杆菌HNJ6用于制备抑制结直肠癌发生的发酵食品，具有非常广泛的应用前景。