本发明公开了一种利用双酶制备慢消化淀粉的方法，属于生物改性淀粉领域。本发明利用环糊精葡萄糖基转移酶和淀粉分支酶协同处理淀粉，环糊精葡萄糖基转移酶催化产生环糊精的同时生成大量短链片段，淀粉分支酶的作用下将细长型的淀粉分子转变成矮胖型的结构更加紧密的分支结构，从而使淀粉的慢消化性更加明显。通过改变两种酶加入方式、加酶量和反应时间，促进两者之间的协同作用，提高环糊精含量和支链淀粉的分支程度，慢消化和抗性淀粉的含量进一步增加，降低淀粉消化速率，为生物改性制备慢消化淀粉提供新思路。