本发明提供一种自动测绘定位的掘进方法及系统，包括：将设计系统给出的井巷模型离散为底板中轴多段线和井巷断面轮廓多边形；以掘进机的右侧指向为X轴、以掘进机的机头方向指向为Y轴、以与XOY面垂直且总体指向上为Z轴设置掘进机的机身坐标系；按照所述机身坐标系的坐标轴增量标定激光靶球位置到掘进机回转中心的相对位置坐标增量；利用定位机器人和指北仪定位掘进机激光靶球的位置坐标；根据所述激光靶球的位置坐标和激光靶球位置在机身坐标系中的相对位置坐标增量计算掘进机悬臂的运动基点坐标；根据底板中轴多段线、井巷断面轮廓多边形和掘进机悬臂的运动基点坐标控制掘进机对径向断面进行截割。本发明能够精确定位掘进机，操作无人化。