本申请公开了一种过压斩波能耗均衡控制方法，包括：获取列车网络中所有动车的中间电压，计算得到电压均值；计算目标动车的中间电压与电压均值的差值，得到校准压差；其中目标动车为列车网络中任一动车；当列车网络满足调整条件，在原始斩波开通、关断门槛电压上均加上校准压差，得到调整后的斩波门槛电压。本发明中，考虑列车网络中所有的中间电压与目标动车的中间电压的差值，根据该差值调节斩波门槛电压，消除了采样过程中的中间电压误差，避免了因过压斩波不均衡而导致的制动电阻、功率元件烧损等问题，而且本方法适用于各种工况，控制方法实时性高，工程容易实现。本申请还公开了相应的过压斩波能耗均衡控制系统、装置及可读存储介质。