本发明公开了一种基于水射流的防污装置及其防污方法，包括：液压单元，以及与液压单元连接的防污膜；防污膜内设有输送水的管道；管道的入口与液压单元连接，出口位于防污膜的上表面并在防污膜的上表面形成射流孔；液压单元包括水箱、电机以及与水箱连接的水泵，电机带动水泵将水箱内的水输送至防污膜内的管道中，管道中的水从射流孔流出形成水射流；射流孔的直径以及射流孔之间的间距均小于海洋生物的尺寸。本发明的防污装置不仅通过清除水下航行器表面的杂物，防止海洋生物附着在水下航行器上；而且由于防污膜上表面的水射流形成水层，实现减少水下航行器表面的阻力。本发明的防污方法通过水射流实现减阻和防附着的双重效果，具有广泛应用前景。