本发明提供了含STn或F‑STn的糖缀合物及其制备方法和在制备抗肿瘤疫苗中的应用，属于糖类缀合物技术领域。含STn或F‑STn的糖缀合物，所述糖缀合物包括STn或F‑STn和载体；所述STn或F‑STn通过连接键与载体偶联；所述连接键包括酰胺键、肟键或C‑N键；所述载体包括蛋白质、两性离子多糖、脂质或核酸。所述糖缀合物在制备抗肿瘤或癌症的疫苗或制备提高细胞和/或体液免疫应答的药物中的应用。F‑STn的糖蛋白缀合物制备的疫苗能够提高体液免疫和细胞免疫应答，且产生的抗体能够有效地识别STn阳性肿瘤细胞，并且通过ADCC及CDC途径裂解STn阳性肿瘤细胞。