本发明公开了一种铝蜂窝结构有限元模拟方法，包括以下步骤：在三维CAD软件中根据铝蜂窝结构实际尺寸建立铝蜂窝CAD模型，该铝蜂窝CAD模型由7个大小相同的窝孔形成，每个窝孔截面均为正六边形；将所建立的铝蜂窝CAD模型导入有限元前处理软件中，将每个窝孔的面划分成1个四节点四边形的壳单元；在壳单元的每条边上生成1个2节点的梁单元，并将分布在窝孔顶部和底部的梁单元记为第一梁单元，将分布在窝孔中部的梁单元记为第二梁单元；赋予壳单元准静态条件下的应力应变曲线，并赋予第一梁单元和二梁单元刚度曲线。本发明能够准确反映沿窝孔轴向和沿与窝孔轴向垂直方向的力学性能和变形模式。