本发明公开一种小动物称重分类系统，包括钢架、单个通过装置、约束称重装置、环形分拣装置及控制装置，单个通过装置和约束称重装置由前往后依次设在钢架上，环形分拣装置位于约束称重装置的后侧。单个通过装置包括存储斗、通道支架及第一输送机构。单个通过装置通过约束称重装置与环形分拣装置相连相通。环形分拣装置包括工作台、环形保护罩、驱动机构及若干个分拣管道，驱动机构设在工作台上，带动各分拣管道同步环形运动，分拣管道下方设有与其数量相等且一一对应的多个饲养盒。本发明还公开一种使用方法。本发明自动化程度高，称重数据精确度高，分类准确率高，极大减小对小动物的损伤，称重分类过程连续进行，提高了工作效率。