本发明公开了一种生产吐纳麝香的微连续流工艺,其以1,1,3,4,4,6-六甲基四氢化萘(HMT)和乙酰氯为原料，无水氯化铝为催化剂，二氯乙烷等有机物为溶剂;将无水氯化铝、溶剂和乙酰氯在低温条件下混合，得到催化剂相；再将原料HMT和溶剂混合溶解，成为原料相；然后将原料相和催化剂相分别经过预冷后通入微通道反应器中进行反应；最后通入微结构混合模块进行淬灭、分层，而后萃取、旋蒸、重结晶、干燥得到吐纳麝香。本发明的微连续流工艺停留时间短、连续化操作，可提高产品的生产效率；反应过程中热量可及时移走，提高的生产的安全性和产品收率；猝灭过程中热量也可及时移走，降低了猝灭过程的危险性。