本发明实施例提供了一种大埋深软岩隧道大变形控制方法，包括：步骤1，隧道开挖穿越大埋深软岩段时，对拱部120°范围内的围岩进行超前预支护加固处理，在所述围岩上方设置超前预支护1；步骤2，所述超前预支护1施工完成后，进行隧道开挖，步骤3，开挖后对初露围岩进行混凝土初喷2，并施做一层支护3；步骤4，施工系统锚杆，上台阶11采用短锚杆8，中台阶12、下台阶13采用长锚杆9，长锚杆9同时进行注浆加固；步骤5，对二层支护5施工，上台阶11在距离掌子面预定距离的喷射混凝土表面进行二层支护5的施工，中台阶12、下台阶13在距离掌子面2～3榀位置进行二层支护5施工；步骤6，进行仰拱14施工。