本发明涉及一种快速启动高温燃料电池及控制方法，储能电池在发电模块启动过程初期为电加热器供电，电加热器预热辅助电堆，待辅助电堆预热至设定温度后通入燃料开始发电，辅助电堆为电加热器供电预热主电堆，发电过程产生的高温尾气通入主电堆加速预热。本发明增设储能电池组，提高发电模块快速响应能力；增设小规格辅助电堆，降低启动用储能电池容量需求，实现发电单元部分供电能力的快速启动；增设双加热模式，利用辅助电堆为电加热器高效供电，配合发电过程中产生热能同时为主电堆预热，加速热盒主电堆启动过程。