本发明公开了一种燃料电池功率衰减实时监测预警方法，包括：获取燃料电池系统台架测试得到的稳态状态下各功率点下电流I稳与功率P标的映射关系表，及动态状态下电流I动与功率P标、加减载速率V标的映射关系表；计算得到实时电流I实下对应的稳态台架标准功率P标1，动态台架标准功率P标2和台架标准加减载速率V标2；获得稳态响应功率衰减率C稳，动态响应功率衰减率C动，动态响应加减载速率差V动；计算功率衰减故障预警F，包括稳态响应故障等级F稳和动态响应故障等级F动。结合燃料电池汽车实际的运行工况来实时监测燃料电池系统的功率衰减情况，实时得到燃料电池系统性能衰减并进行及时预警。