本发明提供了一种自适应守时授时方法，采用两个计数器分别对滤波后的外部输入信号和本地信号进行计数，以修正本地信号的周期和相位，使本地信号对齐滤波后的外部输入信号，同时还消除了外部输入信号异常情况对本地信号的影响。本发明的方法利用已有的硬件电路资源即可实现，不必增加额外的复杂器件，也不影响其他功能，安全可靠且具备很好的通用性和实用性。本发明的方法已经过实际产品验证，可以实现守时和授时功能，且在首次同步守时或者外部输入信号异常的情况下，不会引起本地信号的跳变、抖动等异常情况。