本发明公开了一种舰载光电跟踪平台控制方法，包括：构建舰载光电跟踪平台的控制对象模型；建立含有扰动的系统状态空间方程；选取扩张状态变量，建立舰载光电跟踪平台的扩张状态空间方程；根据控制量和输出量，建立舰载光电跟踪平台的线性扩张状态观测器，及观测器参数矩阵，得到位置估计值、速度估计值和扩张状态估计值；设计基于分数阶PD控制的状态误差反馈控制律；将观测器和控制器初始参数分别与观测器带宽及控制器带宽相关联，并采用优化算法对观测参数和控制参数进行在线实时优化。本发明具有较强的抗干扰能力，能够有效抑制舰载光电跟踪平台内外扰动，提高目标跟踪精度。