本申请提供一种综合调度方法、装置、系统、电子设备及存储介质。该综合调度方法通过获取与所述高速磁浮列车的行车调度相关的各专业信息；根据所述各专业信息确定调度方案；根据所述调度方案向相应的专业调度系统下发调度指令，以使所述专业调度系统根据所述调度指令执行相应的专业调度。该综合调度方法通过获取各专业信息，且综合各专业信息确定调度方案，可以实现复杂情况下的多专业调度快速配合联动的综合调度指挥，以满足长大干线高速磁浮列车的更加复杂的运行场景。