本发明提供一种逆变电源的输出缺相诊断方法和装置，该方法包括：根据变压器一次侧三相电流重构变压器二次侧输出电流；根据输出三相线电压的波形和电容值得到等效的滤波电容基波相电流；根据所述变压器二次侧输出电流以及所述等效的滤波电容基波相电流得到所述逆变电源的输出电流瞬时值以及预设时间窗口内的输出电流有效值；根据所述输出电流瞬时值和所述输出电流有效值进行输出缺相诊断，不需要在辅助逆变电源输出端安装电流传感器，在不增加硬件的情况下实现辅助逆变电源输出缺相的诊断，节约成本，提高输出缺相诊断的准确性和快速响应，加强了对辅助逆变电源负载和自身的保护，提高列车设备的运行安全性。