本申请公开了一种用于预测药物靶标的信息处理方法及装置，用以提升药物靶标预测的准确性。所述方法包括，获取化合物对应的化合物微扰谱；获取所述化合物所作用的目标基因对应的基因微扰谱；确定所述化合物微扰谱和所述基因微扰谱的相关程度；根据所述相关程度和预设的实验条件数据，对所述化合物能够对所述目标基因产生作用的概率进行预测。采用本申请所提供的方案，在确定化合物是否能够对目标基因产生作用的判断过程中，考虑了化合物微扰谱和基因微扰谱之间的相关性，从而提高了药物靶标预测的准确性。