本发明公开了一种分轴联合循环机组汽轮机负荷控制系统，包括有汽轮机负荷指令模块，包括设有负荷指令值、负荷目标值，用于判断所述负荷指令值与所述负荷目标值的差异信息；速率模块，用于控制所述负荷指令值的升降负荷速率；阀门动作模块，用于控制主调阀的开度大小；汽轮机实际负荷模块，实时采集传输汽轮机实际负荷值，所述汽轮机实际负荷模块与所述汽轮机负荷指令模块信息交互进行控制所述阀门动作模块；胀差保护模块，用于实现汽轮机胀差超过正常值时的抑制，通过设置汽轮机负荷控制系统，解决因运行人员技术水平差异导致阀门开启速率不同的问题，实现了保障汽轮机阀门开启速率平稳，汽轮机温升速率平稳，有效提高自动化程度，提高安全性能。