本发明涉及矿井监测预警技术领域，具体涉及一种工作面水害微震动态监测方法及系统，其中，系统包括：采集模块，用于实时采集矿井底板监测区域的地质数据和微震信号；构建模块，用于根据地质数据构建监测区域的三维地质模型；定位模块，用于采用天然地震定位算法在监测区域对微震信号进行定位，得到微震信号在三维地质模型中的微震位置；分析模块，用于对微震信号进行分析，得到矿井底板的破坏深度；显示模块，用于根据三维地质模型显示微震位置和破坏深度。本发明根据实时的地质数据构建三维地质模型，即使矿井底板的监测区域内的空间形态、分布情况随着时间发生变化，也能够准确地显示微震位置和破坏深度，提高了监测的准确性和抗干扰性。