本发明属于数据安全技术领域，涉及一种基于异构校验的高安全设备配置方法，包括以下步骤：步骤一、使用远程配置客户端，下发配置文件给配置处理单元，所述配置处理单元包含多干配置处理模块；步骤二、若干配置处理模块在配置文件的权限校验通过后，接收配置文件并转换为配置数据发送至配置下发模块；步骤三、配置下发模块接收到配置数据后进行配置校验，校验通过后下发配置数据。本发明使用异构安全的主动防御方式，实现边缘数据的高安全处理，有效阻止外部攻击和自生漏洞所带来的风险。