本申请提供一种编组列车停车控制方法和控制系统，该方法包括：获取前后两辆列车的属性信息；根据属性信息确定后一列车的停车区段；确定停车区段对应的目标速度；将停车区段和对应的目标速度发送至底层控制器，以使底层控制器基于停车区段和对应的目标速度对后一列车进行停车控制。本方法根据前后两辆列车的属性信息确定后一列车的停车区段即对应的目标速度，进而根据停车区段和对应的目标速度对后一列车进行停车控制，能够在不超速的前提下，充分利用高速来追击前车，有效减小两车停站时间间隔，保证后车停准。