本发明涉及桩基工程技术领域，具体公开了一种高桩码头的异型桩基及其施工方法，所述异型桩基包括竖直段桩身以及斜段桩身，所述竖直段桩身、斜段桩身相互连接，形成折线型桩基；所述竖直段桩身设置在岩基中，斜段桩身悬浮在水中，且斜段桩身顶端与码头的上部结构固定连接；通过在岩基上钻孔，在钻孔中种入竖直段桩身，并确定好斜段桩身的倾斜角度，最后通过灌浆固定，最后在斜段桩身顶端浇筑码头的上部结构即完成施工；本发明所提供的异型桩基与现有技术相比具有定位精确，施工方便，较好解决了施工中的碰桩，进一步降低施工难度，尤其适合在没有软弱覆盖土层的岩基条件以及桩基础布置密集的情况下施工。