本发明公开了一种基于数据处理的钢轨水射流打磨作业升降系统及操作方法，所述系统包括设于作业车上的动力装置单元、升降定位单元及控制单元；动力装置单元为系统运转提供电、气及液压动力；升降定位单元包括门子架、升降油缸、升降导向机构、锁定闸、激光测距仪及升降架，通过激光测距仪实时测量数据，控制单元控制升降油缸带动升降架在升降导向机构导向下进行稳定地升降工作，使装载于升降架上的水射流刀准确下降至打磨点，锁定闸进行合闸配合升降油缸自锁，在打磨作业时对升降架进行全方位的锁定；通过在动力装置单元底部设有第二减振部，在门子架底部设有第一减振部，阻断振动传导，使水射流刀其能够稳定地进行打磨作业，从而提高了打磨精度。