本发明提供了一种钢轨纵向电阻和过渡电阻测量系统，包括测量电源模块MSk、电阻测量模块MRRk和数据处理模块DPk，所述测量电源模块MSk的恒直流电源的正极接入牵引变电所TSSk的直流负母线LNk，负极分别通过第一控制开关SP1k与排流柜排流端子TGk连接、通过第二控制开关SP2k与变电所接地母排Gk连接、通过第三控制开关SP3k与均流线LJLk连接；所述电阻测量模块MRRk的四组电压测量传感器分别布置在上下行钢轨的4根钢轨上；所述数据处理模块DPk用于控制恒直流电源、采集电压测量传感器测量数据、计算钢轨纵向电阻和过渡电阻。本发明可实现自动测量、构造简单，系统元件数目少，集成度高，操作方便。