本发明公开了一种基于曝气氧化与废酸熟化的铜锌浮选尾矿生物浸出方法，包括以下步骤：S1、铜锌浮选尾矿曝气预氧化：将铜锌矿浮选尾矿进行薄层筑堆，筑堆厚度≤500mm，在自然通风条件曝气氧化；S2、将曝气预氧化的铜锌浮选尾矿用湿法冶金浸出液回收的废酸进行熟化处理；S3、生物浸出：将优选的五种菌群以及从原矿上原位富集的菌群组成组合菌群，连续扩大培养形成菌液，菌液与预酸化铜锌浮选尾矿混合进行生物间歇式搅拌曝气槽式浸出，曝气泵持续曝气，得到铜锌浸出液。该方法实现了对含硫化矿浮选尾矿中有价金属Cu和Zn等的高效浸出，有效的解决了铜锌浮选尾矿资源化利用与无害化处理生物浸出过程存在的浸出速率慢、容易出现钝化层等问题。