本发明公开了一种用于船舶航行性能实时分析系统及营运碳排放优化方法，包括船端服务器和岸端服务器，所述的船端服务器由数据采集模块、数据处理模块、数据分析模块、数据存储模块、航行性能监测模块和气象数据解析模块六个模块组成。所述的岸端服务器主要负责气象数据的下载、解析以及传输。本发明通过对船舶航行数据的收集，实现了船舶营运性能的实时监测，并且建立了船体与螺旋桨污损与运营性能之间的联系，能够准确地获知坞修时间，并且当船舶营运性能下降，碳排放上升时，能够采取多种措施对船舶营运碳排放进行优化，从而提升船舶的营运性能，使得船舶在整个服役周期内均能保持良好的运行状态，实现船舶智能化、低碳化的节能减排目标。