本发明公开了一种高抗消化性高直链淀粉‑脂质复合物的制备方法，属于淀粉加工领域。所述方法是以高直链淀粉为原料，以脂质为配体，首先采用水热法制备高直链淀粉‑脂质复合物，再对水热法制备得到的复合物进行湿热处理。本发明以高直链玉米淀粉为原料，以月桂酸为代表性脂质配体，通过水热‑湿热复合处理制备高直链玉米淀粉‑月桂酸复合物，大幅增加了产品中抗性淀粉含量，最高达到63.97％，高于高直链玉米淀粉、湿热处理高直链玉米淀粉和未湿热处理高直链玉米淀粉‑月桂酸复合物的抗性淀粉含量，具有降低血糖水平、保持肠道健康的作用。本发明具有工艺简单，成本能耗较低，易于连续化生产，无污染等优点。